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[求助]
TA克隆,連接轉(zhuǎn)化能長(zhǎng)菌落,但是菌液PCR鑒定沒有結(jié)果 已有4人參與
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PCR擴(kuò)增產(chǎn)物1%瓊脂糖凝膠電泳,試劑盒回收純化PCR產(chǎn)物,電泳檢測(cè)條帶單一,濃度為50ng/微升。 PCR產(chǎn)物和pMD 18-T 載體連接,連接體系是:PCR產(chǎn)物3.5微升,pMD 18-T vector 1微升,水0.5微升,Solution I 5微升。16℃連接3h,使用的是PCR儀器。 固體LB培養(yǎng)基配制:胰蛋白胨1g,酵母浸粉0.5g,氯化鈉1g,加水定容100ml,調(diào)節(jié)PH為7.5,高溫高壓滅菌30min,待溫度適宜,加入IPTG 20微升,X-gal 100微升,AMP 100微升,倒板。 10微升連接產(chǎn)物全部轉(zhuǎn)入50微升大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,冰浴30min,42℃熱激90s,冰浴2min,加入700微升液體LB培養(yǎng)液,37℃恒溫?fù)u床200rpm 1h,4000rpm離心5min,棄上清500微升,重懸浮,涂板,37℃過(guò)夜培養(yǎng)。我看有些人的實(shí)驗(yàn)記錄都是12-14h就能挑菌了,但是我的12-15h內(nèi)很難看清藍(lán)白斑,我一般是等到16-18h之間才能很明顯分辨出藍(lán)白斑菌落,這時(shí)候才能挑白斑,于1ml 含1微升AMP的液體LB培養(yǎng)液中,37℃恒溫?fù)u床復(fù)蘇8h。 菌液PCR鑒定,10微升體系是:Taq酶0.05微升,buffer 1微升,dNTP 0.8微升,上游引物0.5微升,下游引物0.5微升,菌液1微升0.5微升0.3微升都有做過(guò),加水至10微升。引物使用的是之前PCR擴(kuò)增引物。反應(yīng)程序有所改變,95℃預(yù)變性時(shí)間從之前的5min變成15min。 挑單克隆菌落的時(shí)候,看著藍(lán)白斑菌落很明顯能分開,并且感覺長(zhǎng)勢(shì)不錯(cuò),信心滿滿,但是菌液PCR怎么都沒有條帶,心都碎了。。。。crying 在半個(gè)月之前用同樣的方法,不同的基因克隆,還做的不錯(cuò),測(cè)序結(jié)果也挺好。 1、有人說(shuō)插入片段和載體的比例,我算了一下,符合比例的范圍啊。 2、不是不長(zhǎng)菌落,能區(qū)分藍(lán)白斑,只是時(shí)間久點(diǎn),感覺長(zhǎng)的還不錯(cuò)。 3、菌液PCR做了梯度,還做了對(duì)照,酶等試劑沒有問(wèn)題。 可是還找不到原因原因到底在哪啊。。。。老板不管你中間費(fèi)了多少勁,沒有結(jié)果可不行啊。。。求小伙伴兒分析原因,相助 |

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謝謝各位回復(fù)。 經(jīng)自己的不斷重復(fù)摸索,成功連接了一個(gè),并且成功測(cè)序。今天做的菌液PCR鑒定也成功擴(kuò)增出陽(yáng)性克隆,已送去測(cè)序。 1、克隆相關(guān)的試劑一個(gè)都沒有更換。 2、懷疑連接時(shí)間不夠,把連接時(shí)間增加到6h左右。 3、懷疑與菌液濃度有關(guān),把搖菌所加液體LB培養(yǎng)基增加到4ml和2ml,且都有擴(kuò)增成功。 我認(rèn)為一般克隆不成功的原因,再排除操作手法的原因之后,最大可能得原因有兩點(diǎn): 1、連接不成功 2、菌液PCR環(huán)節(jié)出了問(wèn)題,最有可能就是菌液濃度。 希望給自己,也給大家一個(gè)經(jīng)驗(yàn)參考。 |

木蟲 (著名寫手)
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(16℃連接3h,使用的是PCR儀器。)我一直都是放保溫杯里,16℃過(guò)夜的,十次有8.9次成功。 別用藍(lán)白板篩選,別加IPTG,直接加AMP篩選。選他8個(gè),8個(gè)沒有就不用在篩了。 最主要的還是pMD 18-T ,國(guó)產(chǎn)的往往今天能連上,一個(gè)星期后就連不上了,這個(gè)我還是用TAKARA的,小日本試劑的穩(wěn)定性還是可以的。 PCR時(shí)不要用高保真酶。 |




版主 (著名寫手)
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菌長(zhǎng)出來(lái)了,應(yīng)該不是轉(zhuǎn)化的問(wèn)題,考慮是不是載體問(wèn)題,會(huì)不會(huì)自連了,我們用19t,有時(shí)候假陽(yáng)性特別多,p不出來(lái),后來(lái)酶切發(fā)現(xiàn)全都自連的,后來(lái)?yè)Q個(gè)批次就好了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |



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