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gyoyo新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
materials studio安裝與作業(yè)調(diào)度 已有2人參與
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想請(qǐng)教大家一個(gè)問(wèn)題，我在集群上安裝了MS，但是不會(huì)寫(xiě)作業(yè)調(diào)度的腳本。我現(xiàn)在有一個(gè)該集群上vasp的pbs提交作業(yè)腳本，我想能不能通過(guò)簡(jiǎn)單修改這個(gè)pbs來(lái)給MS提交作業(yè)用呢？ #!/bin/bash # ##PBS -q sixteen #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=240:00:00 #PBS -j oe #PBS -V # go to work dir cd $PBS_O_WORKDIR # The program we want to execute export EXEC=/share/apps/vasp/bin/vasp-5.2.12_impi4.1.0.024_mkl12 export NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` export N_MPD=`cat $PBS_NODEFILE|uniq|wc -l` # Intel MPI Home MPI_HOME=/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64 $MPI_HOME/bin/mpdcleanup -r ssh -f $PBS_NODEFILE $MPI_HOME/bin/mpdboot -r ssh -n $N_MPD -f $PBS_NODEFILE # running program $MPI_HOME/bin/mpiexec -genv I_MPI_DEBUG 3 -n $NP $EXEC #vaspcal.sh -l 70 -a 40 -A 60 # clean mpd daemon $MPI_HOME/bin/mpdallexit 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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2樓2016-09-19 23:34:33
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3樓2016-09-20 08:43:12
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4樓2016-09-20 15:29:06
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5樓2016-09-20 15:57:32
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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參考中科大《Materials Studio軟件的安裝與并行計(jì)算使用手冊(cè)》，直接用命令調(diào)用相應(yīng)的模塊就可以了 這個(gè)手冊(cè)網(wǎng)上很好找的 http://www.docin.com/p-1326023646.html |
6樓2016-09-21 14:42:24
guazifeng
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7樓2016-09-23 00:10:50
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