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qingchul新蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何在網(wǎng)上查找辣椒疫霉有關(guān)基因上下游序列，急 已有1人參與
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| 本人研究方向辣椒疫霉，準(zhǔn)備做一個敲除，但是基因下游序列一直擴增不出來，在網(wǎng)上找不到，可能是我水平菜的問題，想請教各位蟲友，你們一般怎樣查找一個基因的下游序列，我在網(wǎng)上也百度了，很少有與疫霉相關(guān)的，謝謝 |
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kuaile5420: 金幣+1, 歡迎發(fā)帖交流 2016-10-08 23:07:28
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去ncbi找全基因組，然后定位基因，然后 下游，讀文獻看看有文獻報道不 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
2樓2016-10-08 22:45:53
qingchul
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3樓2016-10-08 22:52:46
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一般基因有在基因組的起始和結(jié)束位置，我以前做的植物，但不知道微生物這種環(huán)形的基因組怎么計算起始和結(jié)束的，然后知道后在全基因組就可以看到下游序列了 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
4樓2016-10-08 23:00:01
小冀-
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ncbi里有，你找到這個菌的目的基因，點進去之后下邊有一個圖，那里會有該基因在基因組中的位置，表達方向和一些臨近基因的信息 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2016-10-08 23:06:13
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gene詞條里輸入相關(guān)基因 進入之后能看到具體定位的位置 染色體什么的 然后下拉找到mapview 點genbank格式 通過調(diào)整顯示上下游的堿基位置就能知道了 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
6樓2016-10-09 18:30:41
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