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qingchul新蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何在網(wǎng)上查找辣椒疫霉有關(guān)基因上下游序列,急 已有1人參與
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| 本人研究方向辣椒疫霉,準(zhǔn)備做一個敲除,但是基因下游序列一直擴增不出來,在網(wǎng)上找不到,可能是我水平菜的問題,想請教各位蟲友,你們一般怎樣查找一個基因的下游序列,我在網(wǎng)上也百度了,很少有與疫霉相關(guān)的,謝謝 |
金蟲 (正式寫手)
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去ncbi找全基因組,然后定位基因,然后 下游,讀文獻看看有文獻報道不 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
新蟲 (小有名氣)
金蟲 (正式寫手)
一般基因有在基因組的起始和結(jié)束位置,我以前做的植物,但不知道微生物這種環(huán)形的基因組怎么計算起始和結(jié)束的,然后知道后在全基因組就可以看到下游序列了![]() ![]() 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
版主 (著名寫手)
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ncbi里有,你找到這個菌的目的基因,點進去之后下邊有一個圖,那里會有該基因在基因組中的位置,表達方向和一些臨近基因的信息 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

新蟲 (正式寫手)
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gene詞條里輸入相關(guān)基因 進入之后能看到具體定位的位置 染色體什么的 然后下拉找到mapview 點genbank格式 通過調(diào)整顯示上下游的堿基位置就能知道了 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |

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