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憨憨可愛多木蟲 (正式寫手)
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差異基因GO富集分析無顯著的富集項
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| 在做轉(zhuǎn)錄組差異基因GO富集分析的時候，在校正后的P-Value<0.05閾值下無顯著的富集項目，請問這樣的結(jié)果正常么？對后續(xù)分析有什么影響��？有沒有類似的情況發(fā)生啊，貌似目前我自己還沒有看到過類似的文章。請各位大神指教指教啊。 |
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xingzhou823
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4樓2016-10-13 14:36:24
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5樓2016-10-13 14:41:04
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6樓2016-10-14 08:53:39
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送紅花一朵 |
非常感謝您！我的差異基因只有500多個（padj<0.05）。我比較關(guān)注的是差異基因的生物學(xué)功能，但是功能注釋不只有GO富集分析，在不改變差異基因閾值的前提下（因為如果修改了差異基因閾值，差異基因增多了，但是多的這些基因是否是我需要的就要打個問號了�。鶕�(jù)其他基因功能注釋的來預(yù)測分析這些差異基因的功能是否也是準確可靠的呢？最后請教個文章寫作方面的就是在后續(xù)文章寫作中（基于不改變差異基因閾值前提），我是否可以少寫或者不寫GO富集分析結(jié)果呢，因為沒有統(tǒng)計學(xué)意義，而是盡可能詳細的分析這些差異基因在自交不親和（我做的自交/異交處理）過程中所起的生物學(xué)作用呢？ |
7樓2016-10-14 09:39:33
偶爾--apple
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