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lusandanooo銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
請教，如何預(yù)測一個(gè)蛋白和另一個(gè)基因有相互作用關(guān)系？ 已有3人參與
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已知條件：原核生物，某蛋白A能結(jié)合某靶基因B，蛋白A有一個(gè)同源蛋白a，基因B有一個(gè)同源基因b。無文獻(xiàn)報(bào)道a和b有相互作用。 問題：如何用生物信息學(xué)手段預(yù)測a和b之間有相互作用（a能結(jié)合到b的啟動(dòng)子上）？ |
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lusandanooo
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14樓2016-11-09 08:56:12
lusandanooo
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| 頂 |
2樓2016-11-02 11:31:28
lusandanooo
銀蟲 (小有名氣)
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3樓2016-11-02 16:24:18
lusandanooo
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4樓2016-11-03 08:47:24
yangbaov
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 小分子能否和protein作用可以用對接，大分子（dna）和protein作用也可以預(yù)測，有軟件的。這是我?guī)啄昵翱吹降奈墨I(xiàn)，現(xiàn)在忘了名字了。 不過預(yù)測結(jié)果非常不準(zhǔn)確。 如果有AB的晶體結(jié)構(gòu)你可以看看晶體結(jié)構(gòu)中AB的internation interface殘基和核苷酸如何作用的。 找到同源蛋白a和同源基因b同樣位置的殘疾與核苷酸，看結(jié)構(gòu)是否差異較大，如果差異較小，那么認(rèn)為很可能有相互作用。 |
5樓2016-11-03 09:05:29
lusandanooo
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6樓2016-11-03 17:20:37
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7樓2016-11-03 17:45:37
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9樓2016-11-05 02:40:50
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10樓2016-11-07 09:51:45
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