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lusandanooo銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
請教,如何預測一個蛋白和另一個基因有相互作用關(guān)系? 已有3人參與
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已知條件:原核生物,某蛋白A能結(jié)合某靶基因B,蛋白A有一個同源蛋白a,基因B有一個同源基因b。無文獻報道a和b有相互作用。 問題:如何用生物信息學手段預測a和b之間有相互作用(a能結(jié)合到b的啟動子上)? |

銀蟲 (小有名氣)

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銀蟲 (小有名氣)
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金蟲 (正式寫手)
| 小分子能否和protein作用可以用對接,大分子(dna)和protein作用也可以預測,有軟件的。這是我?guī)啄昵翱吹降奈墨I,現(xiàn)在忘了名字了。 不過預測結(jié)果非常不準確。 如果有AB的晶體結(jié)構(gòu)你可以看看晶體結(jié)構(gòu)中AB的internation interface殘基和核苷酸如何作用的。 找到同源蛋白a和同源基因b同樣位置的殘疾與核苷酸,看結(jié)構(gòu)是否差異較大,如果差異較小,那么認為很可能有相互作用。 |
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