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瀟湘妃子。鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
金線蓮植物基因組DNA提取、純化及PCR實(shí)驗(yàn)問(wèn)題
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求助各位大神兩個(gè)問(wèn)題: 實(shí)驗(yàn)?zāi)康模何以谧鼋鹁蓮這種中草藥植物基因組DNA提取的實(shí)驗(yàn),然后特定序列PCR擴(kuò)增后,對(duì)不同來(lái)源的藥材做一個(gè)鑒別。 1、實(shí)驗(yàn)遇到的問(wèn)題:買的是天恩澤的DNA提取試劑盒,可是提取出來(lái)后檢測(cè)核酸濃度,才只有10ng/μl左右,而且在260nm處的吸收值只有0.2左右,280nm處的吸收值在0.1左右,A260/A280的比值只有1.4~1.5,不懂這些數(shù)據(jù)說(shuō)明什么,同學(xué)說(shuō)這個(gè)濃度就等于幾乎沒(méi)提出來(lái),還是提取的DNA雜質(zhì)量太多了?接下來(lái)應(yīng)該從哪些方面著手,有什么好的純化方法,可以通過(guò)酚、氯仿等來(lái)提純嗎? 2、接著上面的實(shí)驗(yàn)繼續(xù)說(shuō),提取出來(lái)基因組DNA后,計(jì)劃的是選擇ITS2這段基因,可是因?yàn)椴恢涝诮鹁蓮中這個(gè)序列的堿基組成,沒(méi)法設(shè)計(jì)特定引物。同學(xué)讓我用了他另外一種植物ITS2序列設(shè)計(jì)出來(lái)的引物,我用他這個(gè)引物按照購(gòu)買的PCR試劑盒操作,凝膠成像結(jié)果顯示,確實(shí)有擴(kuò)增出來(lái)一個(gè)大約500bp的條帶。可現(xiàn)在又有人說(shuō),因?yàn)檫@個(gè)不是針對(duì)我這種植物設(shè)計(jì)出的特定引物,即使擴(kuò)增出來(lái),有條帶顯示,但無(wú)法說(shuō)明該條帶是我的目的序列(也就是ITS2)所擴(kuò)增出來(lái)的條帶,所以我現(xiàn)在又有點(diǎn)困惑了…… 這樣針對(duì)A植物ITS2序列設(shè)計(jì)的引物,能用于擴(kuò)增B植物的ITS2序列嗎? 如果不可以的話,有沒(méi)有對(duì)這方面比較了解的同學(xué)可以指導(dǎo)一下,我到底應(yīng)該如何才能知道我這種植物某一特定基因的序列組成呢? 查閱文獻(xiàn),大家做的比較多的是質(zhì)粒DNA,或者是細(xì)胞、真菌的,關(guān)于植物的文獻(xiàn)實(shí)在是沒(méi)有找到相關(guān)的,小碩一枚,剛開(kāi)始做分子生物學(xué)這塊兒,實(shí)在是不懂的問(wèn)題一堆,懇請(qǐng)各位答疑解惑啊,不勝感激。! |
新蟲(chóng) (初入文壇)
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