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真核細(xì)胞基因組的制備 已有1人參與
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從不同組織細(xì)胞或血細(xì)胞中提取是進(jìn)行基因診斷的先決條件。制備的原則是既要將蛋白質(zhì)、脂類、糖類等物質(zhì)分離干凈,又要保持分子的完整。蛋白酶K的應(yīng)用使這兩個(gè)原則得到了保證。在提取的反應(yīng)體系中,SDS是離子型表面活性劑,主要作用是:(1)溶解膜蛋白而不破壞細(xì)胞 膜;(2)解聚細(xì)胞 中的核蛋白;(3)與蛋白質(zhì)結(jié)合,使蛋白質(zhì)變性而沉淀下來(lái)。蛋白酶K可將蛋白降解成小的多肽和氨基酸,使分子盡量完整地分離出來(lái)。具體方法如下: (一)白細(xì)胞的制備 (1)采集外周靜脈血10ml,加1.7ml ACD(檸檬酸0.48g、檸檬酸鈉1.32g、葡萄糖1.47g、加水至100ml,0.6kg/cm2 滅菌30min)抗凝。 (2)將血液放入已滅菌的50ml塑料離心管內(nèi),加30mlSTMT[0.32mol/L蔗糖、10mmol/l Tris-HCl(pH7.5)、5mmol/L MgCl2 、1%Triton –X 100],輕輕上下振蕩至透明,紅細(xì)胞 完全溶解。 (3)冰浴10min,離心,3000rpm,10min。棄上清,STMT重復(fù)處理1~3次。 (4)棄上清,白色沉淀物加10ml STE[0.1mol/L NaCl、10mmol/l Tris-HCl(pH8.0)、1mmol/L EDTA(pH8.0)],先少量,充分混勻,然后加10mg/ml蛋白酶K100μl,20%SDS30μl,搖勻,置37℃水浴15~20h。 (5)用等體積飽和酚抽提,3000rpm離心5min。 (6)用大口鈍緣吸管小心吸取上層水相,加飽和酚和氯仿-異戊醇(24:1)抽提,3000rpm離心5min 。 (7)小心吸取上層水相,用等體積氯仿-異戊醇(24:1),抽提,3000rpm離心5min。 (8)小心吸取上層水相,加入1/10體積3mol/l NaAc,2.5體積預(yù)冷無(wú)水乙醇混勻,-20℃過(guò)夜。 (9)將白色絮狀沉淀物用玻璃棒挑出,放入Eppendorf管內(nèi),加1ml 75%乙醇4℃靜置1h,離心,10000rpm 10min。 (10)棄上清,用蠟?zāi)⒐芸诜夂,針刺?shù)個(gè)小孔,真空抽提(10~15min)。 (11)加200μl 1×TE溶解,置4℃保存。 (12)對(duì)所提用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行定量和純度檢測(cè)。 (13)取2~4μl 樣品,經(jīng)瓊脂糖凝膠(Agarose)電泳,檢查所提的質(zhì)量及降解情況。 (二)組織的制備 (1)將200mg組織在冰浴條件下用消毒剪刀充分剪碎,加4ml 1×RSB緩沖液(10mmol/L Tris, pH7.4;10mmol/l NaCl;25mmol/L EDTA,pH7.4)放入10ml帶蓋的塑料管中。 (2)加SDS至濃度為1%(可加0.4ml10%SDS),混勻。由于從核中釋放出來(lái),樣品變得粘稠。 (3)加10mg/ml蛋白酶k 44μl,終濃度為100μl/ml,37℃保溫1~3d,直到組織完全解體。中間可振動(dòng)樣品管幾次。加0.4ml 5mol/L NaCl。 (4)用等體積飽和酚、1/2體積飽和酚和1/2體積氯仿-異戊醇及等體積氯仿-異戊醇(24:1)各抽提一次,3000rpm離心5min,用大口鈍緣吸管小心吸取上層水相。 (5)加2.5倍體積預(yù)冷無(wú)水乙醇沉淀。用一玻璃棒收集白色纖維絲狀的大片段,并移入一新管,吸干中的無(wú)水乙醇。 (6)溶于4ml 0.1×SSC中,4℃過(guò)夜可作進(jìn)一步純化。 (7)加20μl RNase A(10mg/ml),37 ℃保溫5h。加0.4ml 5mol/L NaCl。 (8)同上法用飽和酚、氯仿-異戊醇抽提,乙醇沉淀離心,棄上清。 (9)75%乙醇洗滌2次,離心,棄上清,真空抽干。適量1×TE溶解,保存在4℃。 |
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