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chemdeer新蟲 (初入文壇)
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[求助]
計算弱相互作用的分子搭建
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大家好。我現(xiàn)在要計算一個金屬和配體間的弱相互作用。配體的甲基會因為這個作用而發(fā)生形變，比如鍵長鍵角會偏離標(biāo)準(zhǔn)的甲基的鍵長鍵角。請問我應(yīng)該怎么搭建這個分子呢？ 我之前搭建的結(jié)構(gòu)一優(yōu)化，分子結(jié)構(gòu)就散掉了，得不到文獻(xiàn)上的結(jié)構(gòu)。用的是b3lyp+d/def2-svp 算的。 |
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2樓2017-04-17 20:27:23
3樓2017-04-17 21:57:57
papaxia
至尊木蟲 (著名寫手)
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4樓2017-04-18 06:52:22
chemdeer
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5樓2017-04-19 14:38:08
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高斯顯示金屬和配體間沒有鍵連是正常的，好多都會出現(xiàn)這種情況，不是說沒有顯示就沒成鍵，高斯是根據(jù)距離顯示是否成鍵的。只要優(yōu)化正常結(jié)束，結(jié)構(gòu)合適就可以了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
6樓2017-04-19 15:14:20
chemdeer
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7樓2017-04-20 00:25:12
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