 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1789 | 回復(fù): 3 | ||
柳伊妃鐵桿木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
amber模擬受體-配體復(fù)合物報(bào)錯(cuò)，小分子力場問題
|
|
用amber模擬受體配體復(fù)合物出錯(cuò)，麻煩各位大神看看究竟是什么問題，如何解決呢？ > com = loadpdb gcx171.pdb Loading PDB file: ./gcx171.pdb -- residue 0: duplicate [ C] atoms (total 18) -- residue 0: duplicate [ H] atoms (total 2) -- residue 0: duplicate [ N] atoms (total 5) -- residue 0: duplicate [ O] atoms (total 2) Warning: Atom names in each residue should be unique. (Same-name atoms are handled by using the first occurrence and by ignoring the rest. Frequently duplicate atom names stem from alternate conformations in the PDB file.) Bond: Maximum coordination exceeded on .R<UNK 0>.A<H3 7> -- setting atoms pert=true overrides default limits ATOMS NOT BONDED: .R<UNK 0>.A<C 4> .R<UNK 0>.A<H3 7> !FATAL ERROR---------------------------------------- !FATAL: In file [atom.c], line 445 !FATAL: Message: bondAtomProblem found ! !ABORTING. |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
271材料工程求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料工程專碩調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求材料調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
 |
2樓2017-08-19 17:29:39
3樓2018-08-29 09:13:59
王小寧8888
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 75.4
- 帖子: 19
- 在線: 15.6小時(shí)
- 蟲號: 14184541
- 注冊: 2019-02-17
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2020-11-09 15:40:19
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 柳伊妃 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +4 | Ymlll 2026-03-18 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +4 | Tyoumou 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)319求調(diào)劑 +6 | 錦鯉0909 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +8 | 陌宸希 2026-03-16 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +3 | 梁梁校校 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +6 | 為學(xué)666 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 本人考085602 化學(xué)工程 專碩 +16 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自動化所實(shí)習(xí) +6 | Losir 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中科大材料與化工319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學(xué)一志愿川大藥學(xué)327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請] 現(xiàn)在如何回避去年的某一個(gè)專家，不知道名字 +3 | zk200107 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 255求調(diào)劑 +3 | 李嘉慧， 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | 李政瑩 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 152697 2026-03-12 | 4/200 |
|