 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1410 | 回復(fù): 8 | |||
| 當(dāng)前主題已經(jīng)存檔。 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
bents鐵蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【求助】如何正確輸入BSSE文件
|
||
| 我的體系含有Ru, O , H ,C 原子，采用B3LYP/GENECP 基組 請(qǐng)問(wèn)如何輸入正確的 計(jì)算相互作用的文件 謝謝大家的幫助 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
ELISA試驗(yàn)中不容忽視的細(xì)節(jié)盤點(diǎn)(二)
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
細(xì)胞培養(yǎng)，這22個(gè)細(xì)節(jié)一定要注意�。ㄒ唬�
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有94人回復(fù)
-
已知面上掛了，小學(xué)校實(shí)驗(yàn)方向無(wú)平臺(tái)，感覺(jué)太難了
已經(jīng)有26人回復(fù)
-
CSC訪學(xué)博后項(xiàng)目獲批，外方學(xué)校暫停合作該怎么辦？
已經(jīng)有51人回復(fù)
-
求助各位大佬，球球了，在這科薩頭
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
七嗪類物質(zhì)合成求助
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
分子動(dòng)力學(xué)模擬合作需求
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
招生材料與化工、環(huán)境科學(xué)調(diào)劑研究生
已經(jīng)有5人回復(fù)
yuhuobuku
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 貴賓: 0.09
- 金幣: 1661.1
- 帖子: 332
- 在線: 6.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 577652
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: MM
- 專業(yè): 量子化學(xué)
9樓2009-03-18 15:26:33
yuhuobuku
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 貴賓: 0.09
- 金幣: 1661.1
- 帖子: 332
- 在線: 6.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 577652
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: MM
- 專業(yè): 量子化學(xué)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
bents(金幣+1):謝謝參與
bents(金幣+5,VIP+0):如果使用ONIOM方法 請(qǐng)問(wèn)是不是也可以呢？ 3-17 10:53
lei0736(金幣+5,VIP+0):謝謝 3-18 08:57
bents(金幣+1):謝謝參與
bents(金幣+5,VIP+0):如果使用ONIOM方法 請(qǐng)問(wèn)是不是也可以呢？ 3-17 10:53
lei0736(金幣+5,VIP+0):謝謝 3-18 08:57
|
用counterpoise關(guān)鍵字： #uB3LYP/6-31G Counterpoise=2 SCF=(tight) C2 + NO --> C2NO 0 2 0 1 0 2 C 0.000000 1.600184 0.000000 1 C 0.000000 0.960265 0.000000 1 N 0.208401 3.031919 0.000000 2 O 1.164068 3.666273 0.000000 2 0 2 0 1 0 2分別代表總體系電荷和多重度，片段一的電荷和多重度，片段二的電荷和多重度。 分子坐標(biāo)后的1和2是定義的片段 用Bq原子： # b3lyp/3-21G** nosymm scf=tight test HBr + H2O manual counterpoise calculation, H2O removed 0 1 H 0.685176 -0.004924 -0.026973 Br -0.771917 0.000050 0.001967 O-Bq 2.536864 -0.000136 -0.051401 H-Bq 3.015128 0.789231 0.184042 H-Bq 3.021888 -0.784986 0.185282 這就相當(dāng)于用HBr + H2O的基組計(jì)算HBr 舉個(gè)例子，比如計(jì)算AB體系的BSSE矯正： 需要得出的五個(gè)能量分別是： 第一個(gè)是整體的能量E(AB) 第二個(gè)是單獨(dú)計(jì)算A的能量E(A) 第三個(gè)是單獨(dú)計(jì)算B的能量E(B) 第四個(gè)是計(jì)算在AB基組下，A的能量E(A/AB) 第五個(gè)是計(jì)算在AB基組下，B的能量E(B/AB) 那么，BSSE energy =E(A)+E(B)-E(A/AB)-E(B/AB)。計(jì)算E(A/AB)的基函數(shù)是計(jì)算AB的基函數(shù)，而計(jì)算E(A)的基函數(shù)只是計(jì)算AB基函數(shù)的一部分，基函數(shù)越多，能量計(jì)算的越準(zhǔn)確，能量計(jì)算越準(zhǔn)確，就越低，所以E(A/AB) 輸出文件里面5個(gè)scf第一個(gè)是整體的能量(記為E(AB))，后面4個(gè)是單體能量，分別是2個(gè)部分在整體基組和各自基組下的能量。 我當(dāng)時(shí)是用-Bq原子算的BSSE矯正， 估計(jì)你是用CP方法吧。但原理都是一樣的。 |
2樓2009-03-17 09:58:02
yuhuobuku
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 貴賓: 0.09
- 金幣: 1661.1
- 帖子: 332
- 在線: 6.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 577652
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: MM
- 專業(yè): 量子化學(xué)
3樓2009-03-17 09:59:34
loovfnd
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 35 (小學(xué)生)
- 貴賓: 1.111
- 金幣: 14361.4
- 散金: 236
- 紅花: 4
- 帖子: 2790
- 在線: 187小時(shí)
- 蟲號(hào): 219674
- 注冊(cè): 2006-03-14
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
4樓2009-03-17 11:04:19
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑22408 288分 +4 | new382 2026-04-02 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料專碩322分 +9 | 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 | 9/450 |
|
|
|
[考博] 材料工程專業(yè)碩士申博 +3 | 麟正宇 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑 +4 | 哇呼哼呼哼 2026-04-02 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 08開頭看過(guò)來(lái)�。�！ +4 | wwwwffffff 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑 +6 | qf626 2026-04-01 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)308分求調(diào)劑（一志愿華東師大） +5 | 相信必會(huì)光芒萬(wàn)?/a> 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +5 | 熹僖XX 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 12138。、m?x?b 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +8 | 薛定諤的虎。 2026-04-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 070300一志愿211，312分求調(diào)劑院校 +14 | 小黃鴨寶 2026-03-30 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +5 | 好好讀書。 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程 085701，267求調(diào)劑 +15 | minht 2026-03-29 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 一志愿華南師范361分，化學(xué)求調(diào)劑 +4 | Nicole88888 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856 335分 +9 | cccchenso 2026-03-29 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 277跪求調(diào)劑 +8 | 1915668 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 抱歉 +4 | 田洪有 2026-03-30 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297 地理學(xué)070500 復(fù)試求調(diào)劑 +3 | 小圓圈圈ooo 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿雙一流機(jī)械285分求調(diào)劑 +4 | 幸運(yùn)的三木 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 394求調(diào)劑 +3 | 好事多磨靜候佳?/a> 2026-03-26 | 5/250 |
|