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siRNA轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng) 已有1人參與
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為了達(dá)到高的轉(zhuǎn)染效率,在轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)過程中,需要注意以下幾點(diǎn): 1.純化siRNA siRNA的濃度和純度對轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)非常重要。為得到高純度的siRNA,推薦用玻璃纖維結(jié)合,洗脫或通過15-20%丙烯酰胺膠除去反應(yīng)中多余的核苷酸,小的寡核苷酸,蛋白和鹽離子。注意:化學(xué)合成的RNA通常需要跑膠電泳純化(即PAGE膠純化)。 2.避免RNA酶污染 微量的RNA酶將導(dǎo)致siRNA轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)失敗。由于實(shí)驗(yàn)環(huán)境中RNA酶普遍存在,如皮膚,頭發(fā),所有徒手接觸過的物品或暴露在空氣中的物品等,因此保證實(shí)驗(yàn)中的每個(gè)環(huán)節(jié)不受RNA酶污染非常重要。 3.健康的細(xì)胞培養(yǎng)物和嚴(yán)格的操作確保轉(zhuǎn)染的重復(fù)性 通常,健康的細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率較高。此外,較低的傳代數(shù)能確保每次實(shí)驗(yàn)所用細(xì)胞的穩(wěn)定性。為了優(yōu)化實(shí)驗(yàn),推薦用50代以下的轉(zhuǎn)染細(xì)胞,否則細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率會隨時(shí)間明顯下降。 4.選擇合適的轉(zhuǎn)染試劑 針對siRNA制備方法以及靶細(xì)胞類型的不同,選擇好的轉(zhuǎn)染試劑和優(yōu)化的操作對siRNA實(shí)驗(yàn)的成功至關(guān)重要。如Entranster-R4000,專門針對siRNA等RNA轉(zhuǎn)染。 5.通過合適的陽性對照優(yōu)化轉(zhuǎn)染和檢測條件 對大多數(shù)細(xì)胞,看家基因是較好的陽性對照。將不同濃度的陽性對照的siRNA轉(zhuǎn)入靶細(xì)胞(同樣適合實(shí)驗(yàn)靶siRNA),轉(zhuǎn)染48小時(shí)后統(tǒng)計(jì)對照蛋白或mRNA相對于未轉(zhuǎn)染細(xì)胞的降低水平。過多的siRNA將導(dǎo)致細(xì)胞毒性以至死亡。 6.通過標(biāo)記siRNA來優(yōu)化實(shí)驗(yàn) 熒光標(biāo)記的siRNA能用來分析siRNA穩(wěn)定性和轉(zhuǎn)染效率。標(biāo)記的siRNA還可用作siRNA胞內(nèi)定位及雙標(biāo)記實(shí)驗(yàn)(配合標(biāo)記抗體)來追蹤轉(zhuǎn)染過程中導(dǎo)入了siRNA的細(xì)胞,將轉(zhuǎn)染與靶蛋白表達(dá)的下調(diào)結(jié)合起來。 |
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