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zhangh1985木蟲 (小有名氣)
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【求助】beilstein數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)出的sd（sdf）文件
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我在beilstein數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索分子后，導(dǎo)出了sd文件，可查看時(shí)都是二維平面分子，請(qǐng)問各位大蝦，有沒有什么辦法直接導(dǎo)出三維的sd文件？謝謝！�。� [ Last edited by zeoliters on 2009-11-15 at 22:54 ] |
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4樓2009-07-22 15:43:00
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6樓2009-07-23 08:33:53
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您好，我不知道discoverygate是什么啊，是不是Elsevier有關(guān)啊，如果是Elsevier 里的東西，我是不是需要一個(gè)一個(gè)的輸入化合物名找到3D結(jié)構(gòu)再保存為sd文件呢？我試過openbabel這個(gè)轉(zhuǎn)換軟件，將2D結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換為3D結(jié)構(gòu)后發(fā)現(xiàn)還是有錯(cuò)誤，是不是本來是2D的結(jié)構(gòu)的，如果不指明其它條件，會(huì)不會(huì)軟件自動(dòng)轉(zhuǎn)變?yōu)榉�(wěn)定構(gòu)型，而不管化合物本身的R或S構(gòu)型了呢？謝謝！ |
8樓2009-07-23 10:05:34
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9樓2009-07-23 11:25:36
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10樓2009-07-23 12:59:53
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