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大家來(lái)探討下分子生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)等生物類(lèi)專業(yè)必須掌握的技能及軟件有哪些？ 已有5人參與
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大家來(lái)探討下分子生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)等生物類(lèi)專業(yè)必須掌握的技能及軟件有哪些？ 也就是生物類(lèi)的專業(yè)，必須要掌握哪些技能和軟件。 希望大家來(lái)探討一下~~~哈哈。謝謝。 |
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可以說(shuō)相關(guān)軟件多如牛毛，關(guān)鍵看你做什么課題，還取決于你處理數(shù)據(jù)量的大小和你所用的設(shè)備來(lái)源。 一般來(lái)說(shuō)，一個(gè)小實(shí)驗(yàn)室中用來(lái)看看序列什么的可以用Chromas，DNAstar，DNAedit，DNAman，VectorNTI等，尤其是VectorNTI，可以提供數(shù)據(jù)庫(kù)功能，也可以進(jìn)行BLAST，multiple Alignment等運(yùn)算，最適合一般的高校、研究所實(shí)驗(yàn)室使用。引物設(shè)計(jì)一般用PremierPrimer，Oligo等；畫(huà)質(zhì)粒用Simvector等； 以蛋白質(zhì)為研究對(duì)象的實(shí)驗(yàn)室，還需要一些特定的可以看分子3D結(jié)構(gòu)的軟件，比如Rasmol，DeepViewer等免費(fèi)軟件，一些華麗軟件如Chemoffice，MaterialStudio，Sybyl，InsightII等也是選擇。 搞核磁的，少不了Feelix；搞質(zhì)譜的，少不了GPMAW；搞家系的，少不了Pedigree之類(lèi)的軟件。 搞測(cè)序的，最好有個(gè)Linux平臺(tái)，上面有GeneScan，Seqlab，GCG包等軟件。用Pipeline可以把很多工序串起來(lái)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。 文獻(xiàn)管理工具，肯定是ENDnote，至少這個(gè)東西，在大多數(shù)雜志的引用鏈接頁(yè)面上，是最上面的那個(gè)，用起來(lái)方便。其他的RM等等也不錯(cuò)。還有個(gè)相關(guān)工具是RefViz，也是必用工具。 10多年前，國(guó)內(nèi)還有人做很不錯(cuò)的軟件，現(xiàn)在似乎沒(méi)有人做了。都是國(guó)外的東西。 隨便寫(xiě)了點(diǎn)，期待有全面的介紹。 |
3樓2009-10-12 00:29:16
genetics183
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國(guó)內(nèi)現(xiàn)在也有一家公司在寫(xiě)生物軟件，重慶諾京生物信息技術(shù)有限公司，他們的產(chǎn)品包括NoeClone, NoePrimer和Seqcorator, 詳情見(jiàn)下： Seqcorator：先進(jìn)的序列圖形化修飾和展示軟件。Seqcorator是一款全新的生物序列展示軟件。Seqcorator先進(jìn)的序列圖形化展示功能，為實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，信息整合，海量?jī)?nèi)容展示以及繪制文獻(xiàn)中高質(zhì)量的圖形提供了前所未有的靈活性和強(qiáng)大功能。 NoeClone: 克隆設(shè)計(jì)，管理和展示的先進(jìn)虛擬克隆實(shí)驗(yàn)室。圍繞熟悉的克隆項(xiàng)目進(jìn)行設(shè)計(jì)， NoeClone組織了克隆流程，包括多圖譜克隆流程圖，電子克隆，先進(jìn)的序列修飾，雙向序列圖譜協(xié)調(diào)，電子PCR，凝膠模擬以及許多常用的分析功能。 NoePrimer：界面精美清晰，操作簡(jiǎn)便的引物設(shè)計(jì)軟件。NoePrimer為PCR引物設(shè)計(jì)帶來(lái)了從未有過(guò)的簡(jiǎn)單方便。除了擁有常用的引物搜索和分析功能外，NoePrimer還擁有獨(dú)特的高通量引物設(shè)計(jì)以及多分子和多重PCR引物設(shè)計(jì)功能 |
5樓2009-10-13 11:01:24
cherylshen
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8樓2010-05-24 23:26:56
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9樓2012-05-06 21:30:47
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