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大家來探討下分子生物學、微生物學、遺傳學等生物類專業(yè)必須掌握的技能及軟件有哪些？ 已有5人參與
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大家來探討下分子生物學、微生物學、遺傳學等生物類專業(yè)必須掌握的技能及軟件有哪些？ 也就是生物類的專業(yè)，必須要掌握哪些技能和軟件。 希望大家來探討一下~~~哈哈。謝謝。 |
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cnlics
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可以說相關軟件多如牛毛，關鍵看你做什么課題，還取決于你處理數(shù)據(jù)量的大小和你所用的設備來源。 一般來說，一個小實驗室中用來看看序列什么的可以用Chromas，DNAstar，DNAedit，DNAman，VectorNTI等，尤其是VectorNTI，可以提供數(shù)據(jù)庫功能，也可以進行BLAST，multiple Alignment等運算，最適合一般的高校、研究所實驗室使用。引物設計一般用PremierPrimer，Oligo等；畫質(zhì)粒用Simvector等； 以蛋白質(zhì)為研究對象的實驗室，還需要一些特定的可以看分子3D結構的軟件，比如Rasmol，DeepViewer等免費軟件，一些華麗軟件如Chemoffice，MaterialStudio，Sybyl，InsightII等也是選擇。 搞核磁的，少不了Feelix；搞質(zhì)譜的，少不了GPMAW；搞家系的，少不了Pedigree之類的軟件。 搞測序的，最好有個Linux平臺，上面有GeneScan，Seqlab，GCG包等軟件。用Pipeline可以把很多工序串起來實現(xiàn)自動化。 文獻管理工具，肯定是ENDnote，至少這個東西，在大多數(shù)雜志的引用鏈接頁面上，是最上面的那個，用起來方便。其他的RM等等也不錯。還有個相關工具是RefViz，也是必用工具。 10多年前，國內(nèi)還有人做很不錯的軟件，現(xiàn)在似乎沒有人做了。都是國外的東西。 隨便寫了點，期待有全面的介紹。 |
3樓2009-10-12 00:29:16
2樓2009-10-11 23:33:11
4樓2009-10-13 09:00:43
feilr
木蟲 (正式寫手)
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國內(nèi)現(xiàn)在也有一家公司在寫生物軟件，重慶諾京生物信息技術有限公司，他們的產(chǎn)品包括NoeClone, NoePrimer和Seqcorator, 詳情見下： Seqcorator：先進的序列圖形化修飾和展示軟件。Seqcorator是一款全新的生物序列展示軟件。Seqcorator先進的序列圖形化展示功能，為實驗設計，信息整合，海量內(nèi)容展示以及繪制文獻中高質(zhì)量的圖形提供了前所未有的靈活性和強大功能。 NoeClone: 克隆設計，管理和展示的先進虛擬克隆實驗室。圍繞熟悉的克隆項目進行設計， NoeClone組織了克隆流程，包括多圖譜克隆流程圖，電子克隆，先進的序列修飾，雙向序列圖譜協(xié)調(diào)，電子PCR，凝膠模擬以及許多常用的分析功能。 NoePrimer：界面精美清晰，操作簡便的引物設計軟件。NoePrimer為PCR引物設計帶來了從未有過的簡單方便。除了擁有常用的引物搜索和分析功能外，NoePrimer還擁有獨特的高通量引物設計以及多分子和多重PCR引物設計功能 |
5樓2009-10-13 11:01:24
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