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fmj121銅蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助】關(guān)于DOCK報(bào)錯(cuò)
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之前用dock一直很好，今天偶然發(fā)現(xiàn)一個(gè)問(wèn)題，就是在sphgen這一步出現(xiàn)如下錯(cuò)誤： fmt: read unexpected character apparent state: unit 2 named temp2.sph last format  2I5,F8.4,I8,4F12.6)lately reading sequential formatted external IO Aborted 不知道是哪里出問(wèn)題，希望高人指導(dǎo)！ |
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fmj121(金幣+2,VIP+0): 12-14 09:59
lei0736(金幣+4,VIP+0):謝謝 有無(wú)興趣來(lái)本版兼職啊 呵呵 12-16 14:12
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你的蛋白文件太大，超過(guò)了99999，你可以截取你感興趣的部分進(jìn)行對(duì)接。用chemria即可。 如果你問(wèn)，截取的蛋白之后，蛋白就不完整了，怎么辦，其實(shí)對(duì)接的時(shí)候蛋白是固定的，你也是選擇特定范圍對(duì)接的，與你去除的那部分無(wú)關(guān)。 對(duì)接成功后，在用整個(gè)蛋白和配體進(jìn)行分析，這樣是允許的。 如果你覺(jué)得麻煩建議用autodock. 如果你有任何問(wèn)題，請(qǐng)到這里問(wèn)，我會(huì)統(tǒng)一回答： http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1699900 具體原因，我也在一樓提起過(guò)。你仔細(xì)看看。 [ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:24 ] |
2樓2009-12-10 20:20:19
javacfish
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3樓2009-12-14 10:25:13
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4樓2009-12-14 10:54:51
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