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[交流]
【求助】關于DOCK報錯
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之前用dock一直很好,今天偶然發(fā)現(xiàn)一個問題,就是在sphgen這一步出現(xiàn)如下錯誤: fmt: read unexpected character apparent state: unit 2 named temp2.sph last format 2I5,F8.4,I8,4F12.6)lately reading sequential formatted external IO Aborted 不知道是哪里出問題,希望高人指導! |
金蟲 (小有名氣)
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你的蛋白文件太大,超過了99999,你可以截取你感興趣的部分進行對接。用chemria即可。 如果你問,截取的蛋白之后,蛋白就不完整了,怎么辦,其實對接的時候蛋白是固定的,你也是選擇特定范圍對接的,與你去除的那部分無關。 對接成功后,在用整個蛋白和配體進行分析,這樣是允許的。 如果你覺得麻煩建議用autodock. 如果你有任何問題,請到這里問,我會統(tǒng)一回答: http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1699900 具體原因,我也在一樓提起過。你仔細看看。 [ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:24 ] |
金蟲 (小有名氣)
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