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【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人參與
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我想模擬聚合物在金屬團(tuán)簇表面的吸附,想請(qǐng)教大家這樣的體系的config文件如何生成? 另外我把手冊(cè)已經(jīng)看了一遍,但是希望運(yùn)行一下.有么有人根據(jù)手冊(cè)的算例給寫一個(gè)模擬過程,給傳一個(gè)謝謝!! |
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不好意思,又有問題麻煩你了. 我用ms建立我的體系以后生成了一個(gè)帶有xyz坐標(biāo)的文件*.pdb 我想通過編程把里面的格式給修改成config格式. config中原子的坐標(biāo)的格式是下面這樣的. CT 1 -5.367652772 -4.974650238 -5.990217152 -3.753414027 -2.997453843 4.469020573 -4347.618322 785.7157385 1473.633382 我想問: 在編程的輸出,對(duì)于config 第一行 CT 和 1 之間的空格應(yīng)該有幾個(gè)合適,隨便多少都合適嗎? 在第二行的開頭這里的空格要不要?如果要,留幾個(gè)空格合適,謝謝! 還有一個(gè)疑問就是在config開頭有一個(gè)變量natoms是定義原子的數(shù)目,我查看了幾個(gè)例子發(fā)現(xiàn)這個(gè)natoms的數(shù)目和config中包含的數(shù)目不一致..有的config文件中這個(gè)變量都沒有設(shè)定?這是怎么一回事? [ Last edited by tpp001 on 2010-1-27 at 22:07 ] |
11樓2010-01-27 21:58:11
老虎大王
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2樓2010-01-24 16:53:03
3樓2010-01-24 20:21:22
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+3):謝謝 1-25 10:29
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+3):謝謝 1-25 10:29
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難處在于，誰肯費(fèi)這個(gè)時(shí)間教你呢？你多少也應(yīng)該自己學(xué)一些，然后就某一點(diǎn)難以解決之處來提問。如果叫人家給你寫個(gè)通盤的教程，給你個(gè)完整的例子，換了你，你愿意干么？就算你愿意，你有那個(gè)時(shí)間么？大家都很忙啊。 Config文件如何生成，手冊(cè)上講得非常之詳細(xì)，你自己試著下手弄一下，哪里不懂可以提問，這樣好一些，也學(xué)得比較快。關(guān)鍵是要?jiǎng)邮职 ? |
4樓2010-01-25 09:45:24
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