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[交流]
【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人參與
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我想模擬聚合物在金屬團(tuán)簇表面的吸附,想請(qǐng)教大家這樣的體系的config文件如何生成? 另外我把手冊(cè)已經(jīng)看了一遍,但是希望運(yùn)行一下.有么有人根據(jù)手冊(cè)的算例給寫一個(gè)模擬過程,給傳一個(gè)謝謝!! |
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非常感謝你的回復(fù),我這里又有幾個(gè)問題請(qǐng)教 1.對(duì)于體系的config 文件的生成,我打算這樣來做: 用ms來建立我的體系的初試結(jié)構(gòu).然后導(dǎo)出一個(gè)xyz坐標(biāo)的文件, 既然dl_poly要求盒子的中心是體系的原點(diǎn),而ms中原點(diǎn)在盒子的一個(gè)頂點(diǎn)0上,我如果把ms導(dǎo)出的xyz坐標(biāo)，都減去盒子長度的一半就是體系的原點(diǎn)就在盒子的中心了，不知道這樣行嗎？ 2. 因?yàn)榻Ⅲw系，在進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模擬以前，要對(duì)體系進(jìn)行relaxation�？墒俏也恢缿�(yīng)該怎么樣寫進(jìn)行optimising的control 文件，能不能給我傳一個(gè)進(jìn)行optimising的control模板。如果有的話，能不能順便再給我傳一個(gè)進(jìn)行MD模擬的control文件。謝謝。 3. 在control文件中的 jobtime 應(yīng)該怎么設(shè)定，有沒有什么經(jīng)驗(yàn)來確定一下。 |
7樓2010-01-25 16:13:30
老虎大王
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2樓2010-01-24 16:53:03
3樓2010-01-24 20:21:22
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+3):謝謝 1-25 10:29
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lei0736(金幣+3):謝謝 1-25 10:29
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難處在于，誰肯費(fèi)這個(gè)時(shí)間教你呢？你多少也應(yīng)該自己學(xué)一些，然后就某一點(diǎn)難以解決之處來提問。如果叫人家給你寫個(gè)通盤的教程，給你個(gè)完整的例子，換了你，你愿意干么？就算你愿意，你有那個(gè)時(shí)間么？大家都很忙啊。 Config文件如何生成，手冊(cè)上講得非常之詳細(xì)，你自己試著下手弄一下，哪里不懂可以提問，這樣好一些，也學(xué)得比較快。關(guān)鍵是要?jiǎng)邮职 ? |
4樓2010-01-25 09:45:24
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