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[交流]
【求助】DL_POLY的config文件如何生成?? 已有9人參與
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我想模擬聚合物在金屬團簇表面的吸附,想請教大家這樣的體系的config文件如何生成? 另外我把手冊已經(jīng)看了一遍,但是希望運行一下.有么有人根據(jù)手冊的算例給寫一個模擬過程,給傳一個謝謝!! |
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在 dl_poly手冊中關(guān)于Potential Of mean Force Constraints,有這樣的描述 If a number of simulations are conducted with the system constrained to different points along the reaction coordinate then the mean constraint force may be plotted as a function of reaction coordinate and the function integrated to obtain the free energy for the overall process. DL POLY 3 reports the PMF constraint virial, WPMF , for each simulation. Users can convert this to the PMF constraint force from GPMF = -WPMF/dPMF where is dPMF the constraint distance between the two groups used to define the reaction coordinate. 我想問這里計算了the PMF constraint force , 然后可以通過對2個粒子之間的相互限制力與粒子之間的距離積分得到pmf呢?? |
90樓2010-05-05 17:00:22
老虎大王
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2樓2010-01-24 16:53:03
3樓2010-01-24 20:21:22
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4樓2010-01-25 09:45:24
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