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xyzmuch木蟲 (正式寫手)
逍遙王
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[交流]
【求助】castep建立晶體結構時出現孤立的原子是怎么回事 已有3人參與
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我按照構建空間群(Pmn21)、添加原子的順序建立晶體結構后,用棒球式結構顯示后,怎么發(fā)現有的原子是孤立的呢? 謝謝。 我又按照二樓的朋友重新進行了輸入,并且rebuild了晶體,仍然如此。按照分子式不應該出現孤立的原子啊 感謝各位 [ Last edited by xyzmuch on 2010-4-30 at 16:37 ] |

銅蟲 (小有名氣)
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從 Build 菜單中選擇 Add Atom。此選項會打開 Add Atom對話框,也可以在 Atom and Bond 工具欄上單擊相應的按鈕。 進入 Options欄,確認 Test for bonds as atoms are created 被選中。當該選項被選中的時 候,MS Modeling 會在晶體建造過程中,自動產生相應的鍵。MS Modeling 也有一個通用的 Bond Calculation 工具,可以從 Build 菜單中調用,該工具允許你選擇、編輯并定義最佳的成 健方案。在本例中,默認值就已經足夠了。 仍然在 Options 欄中,確認 Coordinatie System是 Fractional。進入到 Atoms 欄中,從 Element 下拉菜單中選擇 Si,并輸入相應的 a、b、c 數據。a=0.480781, b=0.480781, c=0.0。 Si 原子和其對稱原子加入到晶胞內。 同樣的,我們可以加入氧原子。氧原子的參數為 a=0.150179,b=0.414589,c=0.116499。氧 原子和其對稱原子加入到晶胞內,程序會自動計算并加入相關的鍵。 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
古德里安將軍

鐵桿木蟲 (著名寫手)

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