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Choke銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】如何設(shè)定帶分?jǐn)?shù)電荷的H,用于鈍化表面的懸掛鍵 已有4人參與
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(a)在做表面H鈍化時(shí),文章里提到需要用帶分?jǐn)?shù)電荷的H,以防止引入新的表面態(tài)(如圖中紅線所示)。請問這個(gè)功能在MS中能夠?qū)崿F(xiàn)嗎?我看到properties里面有formalcharge這一項(xiàng),是不是就在這里面設(shè)定所需要的分?jǐn)?shù)電荷?幫助文件里對formal charge的定義是:Formal charge is a theoretical number assigned to an atom on the basis that all bonds in a molecule are purely covalent. This means that each atom in the bonding pair is assigned one electron from the bond. 我對文中的理解,以用2/3H對O進(jìn)行鈍化為例,O在SnO2中有3個(gè)鍵,要保持這種結(jié)構(gòu),也需要用3個(gè)H來鈍化,并保持O總共得到2個(gè)電子以達(dá)到complete shell,這樣每個(gè)H應(yīng)貢獻(xiàn)2/3個(gè)電子。2/3H把所有的電子都貢獻(xiàn)給O了,變成了對electronic structure沒有影響的質(zhì)子。請問這樣理解是否正確?如果是這樣的話那改formal charge就不對了,因?yàn)樗詐ure covalent為基礎(chǔ)的。那如何構(gòu)建這樣一個(gè)只帶2/3個(gè)電荷的H原子呢? ![]() 文章鏈接如下 http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z (b) 用H鈍化之后,文中把H-O,H-Sn鍵的鍵長都固定了,請問在MS做結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)能只固定這些bond length嗎? http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp911035z |
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