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[交流]
【求助/交流】MEGA 畫(huà)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中的bootstrap values和Identity scores有什么區(qū)別？ 已有20人參與
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| MEGA 系統(tǒng)發(fā)育分析中，在圖上標(biāo)的值是bootstrap values，這是什么意思，而在文章中我看許多都是對(duì)Identity scores進(jìn)行分析，這兩個(gè)值有什么區(qū)別呀，希望大家回復(fù)！ |
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
scelab(金幣+3):很詳細(xì)~~~ 2010-05-17 21:02:35
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
scelab(金幣+3):很詳細(xì)~~~ 2010-05-17 21:02:35
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Bootstrap values （步長(zhǎng)值）是指在你選擇的遺傳距離算法（一般選擇鄰接法即N-J法）中軟件根據(jù)所比對(duì)序列得到結(jié)果 比如 bootstrap value設(shè)置為1000，即軟件構(gòu)建了相應(yīng)的1000”棵樹(shù)“，在每個(gè)節(jié)點(diǎn)上顯示的bootstrap value 即指在這1000次建樹(shù)過(guò)程中，有相應(yīng)的次數(shù)的頻率這個(gè)分枝內(nèi)的幾株菌或幾段序列在進(jìn)化速度上相似，一般認(rèn)為節(jié)點(diǎn)處的bootstrap value大于500時(shí)分析結(jié)果可信，bootstrap value 在mega ,philiphy,等軟件中常見(jiàn)，而在SAS等軟件中，簡(jiǎn)述過(guò)程相對(duì)麻煩但是 最終顯示的是Identity scores 即遺傳距離，或者指進(jìn)化距離，同樣表示了待分析菌或序列的進(jìn)化關(guān)系的遠(yuǎn)近。 不知道這樣說(shuō)你能否理解 呵呵 兩者是一樣的 很多文獻(xiàn)兩者都認(rèn)可（只要你的分析是正確的就行） |
2樓2010-05-17 21:01:49
exon2002
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4樓2010-05-18 07:32:50
zsxnd
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changhl
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