 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2145 | 回復(fù): 3 | |||
xiaowu787木蟲 (正式寫手)
|
[交流]
【求助】LAMMPS－REAX計(jì)算出錯(cuò) 已有2人參與
|
|
剛學(xué)REAX，想自己做個(gè)輸入文件測試一下，結(jié)果出現(xiàn)如下錯(cuò)誤： LAMMPS (24 Apr 2010) Reading data file ... orthogonal box = (0 0 0) to (3 8 2) 1 by 2 by 1 processor grid 4 atoms Error or end-of-file reading unit 4 on line: 55 rank 0 in job 268 pc07_59580 caused collective abort of all ranks exit status of rank 0: killed by signal 9 應(yīng)該是輸入文件沒有讀完就出現(xiàn)這個(gè)錯(cuò)誤，請高手幫忙看看哪里存在錯(cuò)誤？ 由于只是為了測試，就做了一個(gè)1＊1＊1的MoO3的單胞�，F(xiàn)在只是想測試程序的正常運(yùn)算，力場里的數(shù)據(jù)可能不正確。 in文件 # this run is equivalent to GRASP testtatb units real atom_style charge read_data data.mo pair_style reax 10.0 1.0e-6 pair_coeff * * ffield.reax 1 2 neighbor 1.0 bin neigh_modify delay 0 every 1 check yes fix 1 all nve #Run one minimization to settle the lattice min_style cg minimize 1.0e-6 1.0e-6 100000 1000000 #print the entire lattice dump startdump all atom 2 autest.dump run 100 #but we only wanted printed out now undump startdump data 文件 #Position data for MoO3, 1 molecules 4 atoms 2 atom types 0.0 3.0 xlo xhi 0.0 8.0 ylo yhi 0.0 2.0 zlo zhi Masses 1 15.9990 2 95.9400 Atoms 1 1 0 1.72382 6.02831 0.92410 2 2 0 0.39584 1.40822 0.92410 3 1 0 2.06541 1.19984 0.92410 4 1 0 0.14781 3.06749 0.92410 ffield文件 Reactive MD-force field 39 ! Number of general parameters 50.0000 !Overcoordination parameter 9.5469 !Overcoordination parameter 127.8302 !Valency angle conjugation parameter 3.0000 !Triple bond stabilisation parameter 6.5000 !Triple bond stabilisation parameter 0.0000 !C2-correction 1.0496 !Undercoordination parameter 9.0000 !Triple bond stabilisation parameter 11.5054 !Undercoordination parameter 13.4059 !Undercoordination parameter 0.0000 !Triple bond stabilization energy 0.0000 !Lower Taper-radius 10.0000 !Upper Taper-radius 2.8793 !Not used 33.8667 !Valency undercoordination 7.0994 !Valency angle/lone pair parameter 1.0563 !Valency angle 2.0384 !Valency angle parameter 6.1431 !Not used 6.9290 !Double bond/angle parameter 0.3989 !Double bond/angle parameter: overcoord 3.9954 !Double bond/angle parameter: overcoord -2.4837 !Not used 5.7796 !Torsion/BO parameter 10.0000 !Torsion overcoordination 1.9487 !Torsion overcoordination -1.2327 !Conjugation 0 (not used) 2.1645 !Conjugation 1.5591 !vdWaals shielding 0.1000 !Cutoff for bond order (*100) 2.0038 !Valency angle conjugation parameter 0.6121 !Overcoordination parameter 1.2172 !Overcoordination parameter 1.8512 !Valency/lone pair parameter 0.5000 !Not used 20.0000 !Not used 5.0000 !Molecular energy (not used) 0.0000 !Molecular energy (not used) 3.6942 !Valency angle conjugation parameter 2 ! Nr of atoms; cov.r; valency;a.m;Rvdw;Evdw;gammaEEM;cov.r2;# alfa;gammavdW;valency;Eunder;Eover;chiEEM;etaEEM;n.u. cov r3;Elp;Heat inc.;n.u.;n.u.;n.u.;n.u. ov/un;val1;n.u.;val3,vval4 O 1.3825 4.0000 12.0000 1.9133 0.1853 0.9000 1.1395 4.0000 9.7602 2.1346 4.0000 33.2433 79.5548 5.8678 7.0000 0.0000 1.2104 0.0000 199.0303 8.6699 34.7289 13.3894 0.8563 0.0000 -2.8983 2.5000 1.0564 4.0000 2.9663 0.0000 0.0000 0.0000 Mo 2.4710 5.6504 95.9400 1.8000 0.3285 1.0000 0.1000 6.0000 13.0000 45.0000 4.0000 0.0000 0.0000 0.6062 6.1484 0.0000 0.0000 0.0000 152.6300 3.7659 0.0689 2.9902 0.8563 0.0000 -16.7660 3.1072 1.0338 8.0000 3.4590 0.0000 0.0000 0.0000 1 ! Nr of bonds; at1;at2;De(sigma);De(pi);De(pipi);p(be1);p(bo5);13corr;n.u.;p(bo6),p(ovun1) p(be2);p(bo3);p(bo4);n.u.;p(bo1);p(bo2) 1 2 113.2223 29.8045 86.9949 0.4438 -0.2465 1.0000 16.6234 1.0764 0.1199 -0.1696 7.0000 1.0000 -0.1374 5.4732 1.0000 0.0000 1 ! Nr of off-diagonal terms; Ediss;Ro;gamma;rsigma;rpi;rpi2 1 2 0.1453 1.8849 10.8505 1.6926 1.5319 1.6459 1 ! Nr of angles. at1;at2;at3;Thetao,o;p(val1);p(val2);p(coa1); 1 2 1 83.1375 10.0000 3.5278 0.0000 3.5962 0.0000 2.2128 0 ! Nr of torsions. at1;at2;at3;at4;;V1;V2;V3;p(tor1);p(cot1);n 0 ! Nr of hydrogen bonds;at1;at2;at3;Rhb;Dehb;vhb1 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0703化學(xué) 305求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑，求各位老師收留
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
271材料工程求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料工程專碩調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求材料調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- TS計(jì)算出錯(cuò)
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 計(jì)算neb出錯(cuò)，請高手幫忙看看
已經(jīng)有27人回復(fù)
- CASTEP計(jì)算出錯(cuò)，是不是內(nèi)存問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- lammps關(guān)于反應(yīng)立場安裝與計(jì)算問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 關(guān)于Dictra的計(jì)算問題（主要是關(guān)于計(jì)算過程出錯(cuò)的問題）
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】按照G09說明書計(jì)算熒光出錯(cuò)。出在第二步上。
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】頻率計(jì)算出錯(cuò)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】BSSE計(jì)算出錯(cuò)
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】BSSE計(jì)算出錯(cuò)
已經(jīng)有19人回復(fù)
老虎大王
木蟲 (著名寫手)
- 模擬EPI: 17
- 應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.17
- 金幣: 4774.1
- 散金: 8
- 紅花: 42
- 帖子: 1361
- 在線: 215.2小時(shí)
- 蟲號: 659094
- 注冊: 2008-11-21
- 專業(yè): 金屬結(jié)構(gòu)材料
2樓2010-05-19 13:21:50
xiaowu787
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1406.9
- 散金: 95
- 紅花: 1
- 帖子: 550
- 在線: 430.3小時(shí)
- 蟲號: 326816
- 注冊: 2007-03-18
- 性別: GG
3樓2010-05-19 15:25:31
4樓2016-12-24 12:12:56
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 xiaowu787 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +15 | 大米飯！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
[考研] 材料專碩306英一數(shù)二 +10 | z1z2z3879 2026-03-16 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +6 | 薛云鵬 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +6 | 困于星晨 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +5 | 緒幸與子 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26考研求調(diào)劑 +6 | 丶宏Sir 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +10 | 小樓。 2026-03-12 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 機(jī)械專碩調(diào)劑
+3
|
笨笨兔子 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程315分求調(diào)劑 +3 | yang_0104 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學(xué)與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +3 | S.H1 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 程雨杭 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 328化工專碩求調(diào)劑 +4 | 。，。，。，。i 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 070303一志愿西北大學(xué)學(xué)碩310找調(diào)劑 +3 | d如愿上岸 2026-03-13 | 3/150 |
|