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[交流]
【求助】namd計算鍵能 已有2人參與
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通過NAMD計算單個分子（不是蛋白質(zhì)，只是簡單的有機小分子）的鍵能等參數(shù)，如何實現(xiàn)？ MS中的模型可以被NAMD調(diào)用么？ 謝謝！ |
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4樓2010-05-24 10:49:02
bay__gulf
金蟲 (著名寫手)
劉蘇州
- 模擬EPI: 8
- 應助: 9 (幼兒園)
- 貴賓: 4.85
- 金幣: 2332.8
- 紅花: 1
- 帖子: 1344
- 在線: 271小時
- 蟲號: 592012
- 注冊: 2008-09-03
- 專業(yè): 理論和計算化學
- 管轄: 分子模擬
★ ★ ★
binkwei(金幣+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-05-21 09:26:06
binkwei(金幣+10): 2010-05-21 09:06:32
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-05-21 09:26:06
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不知道你算鍵能還是鍵參數(shù) 前者namd 不能算, 這個量沒有嚴格的意義 后者可以用Gaussian+paratool 或 Spartan 得到 參考 http://www.mdbbs.org/thread-16875-1-1.html MS中的模型可以被NAMD調(diào)用么？ ======= 可以, 但異常復雜 |
2樓2010-05-21 08:42:31
 [ Last edited by binkwei on 2010-5-24 at 10:49 ] |
3樓2010-05-21 09:03:28
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