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redskywei木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助】siesta中transiesta模塊的收斂問題 已有3人參與
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最近在做transieta的計(jì)算，發(fā)現(xiàn)收斂困難，看maillist里主要考慮增加屏蔽層和設(shè)置TS.UpdateDMCROnly，我在設(shè)置TS.UpdateDMCROnly時(shí)，一直不明白這個(gè)東西到底是作用在整個(gè)散射區(qū)還是僅僅與電極結(jié)構(gòu)相重復(fù)的散射區(qū)中左右單元的過度層？這個(gè)coupling terms該怎么理解？ 還有期中有個(gè)人提到TS.UpdateDMCROnly + extra elec layers，又該怎么理解，是說對外電極設(shè)置這個(gè)參數(shù)么？ 我用3層Al電極做左右屏蔽層，TS.UpdateDMCROnly設(shè)置為 T了，還是收斂非差差。近300步才收斂。也不知道哪里問題哦。我的輸入?yún)?shù)如下，請大家指教： NumberOfSpecies 3 NumberOfAtoms 287 %block ChemicalSpeciesLabel 1 6 C 2 7 N 3 13 Al %endblock ChemicalSpeciesLabel PAO.EnergyShift 200 meV PAO.BasisType split PAO.BasisType split PAO.BasisSize DZP LatticeConstant 1.0 Ang %block LatticeVectors 16.19832 0.00000000 0.00000000 0.00000000 16.19832 0.00000000 0.00000000 0.00000000 26.80535368 %endblock LatticeVectors #kgrid_cutoff 20. Ang %block kgrid_Monkhorst_Pack 1 0 0 0.0 0 1 0 0.0 0 0 1 0.5 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack # SPIN options xc.functional GGA # Exchange-correlation functional xc.authors PBE # Exchange-correlation version SpinPolarized F # Logical parameters are: yes or no FixSpin F TotalSpin 0.0 NonCollinearSpin F # 'T', 'F' MeshCutoff 150. Ry # Equivalent plane wave cutoff for the grid # SCF options DM.Tolerance 1.d-4 # Tolerance in maximum difference between input and output DM MaxSCFIterations 300 # Maximum number of SCF iter DM.UseSaveDM F # to use continuation files DM.MixingWeight 0.03 # New DM amount for next SCF cycle DM.NumberPulay 5 DM.MixSCF1 F DM.PulayOnFile F # Store in memory ('F') or in files ('T') # NeglNonOverlapInt T # 'F'=do not neglect SolutionMethod transiesta # OrderN or Diagon or transiesta ElectronicTemperature 300 K # Temp. for Fermi smearing # MD options MD.TypeOfRun CG # Type of dynamics: MD.VariableCell F MD.NumCGsteps 000 # Number of CG steps for coordinate optimization ZM.UnitsLength Ang #the units of length used during Z-matrix input ZM.UnitsAngle deg #the units of angles used during Z-matrix input ZM.ForceTolLength 0.02 eV/Ang #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix lengths ZM.ForceTolAngle 0.00356549 Ry/rad #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix angles ZM.MaxDisplLength 0.1 Ang # controls the maximum change in a Zmatrix length during an optimisation step ZM.MaxDisplAngle 0.003 rad # controls the maximum change in a Z-matrix angle during an optimisation step ZM.CalcAllForces T # Default value [ Last edited by redskywei on 2010-5-29 at 18:21 ] |
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redskywei(金幣+2):謝謝建議，我感覺這個(gè)參數(shù)應(yīng)該不是很多影響的，不過希望可以把這個(gè)參數(shù)的意義說的更清楚些～ 2010-05-29 21:22:18
redskywei(金幣+3):我想同樣的第二周期的原子，應(yīng)該沒這么大的影響吧，我把原子替換看看～～ 2010-05-29 21:24:34
lvjian8596(金幣+1):感謝交流！鼓勵(lì)發(fā)有價(jià)值的話題！ 2010-06-22 22:23:49
redskywei(金幣+2):謝謝建議，我感覺這個(gè)參數(shù)應(yīng)該不是很多影響的，不過希望可以把這個(gè)參數(shù)的意義說的更清楚些～ 2010-05-29 21:22:18
redskywei(金幣+3):我想同樣的第二周期的原子，應(yīng)該沒這么大的影響吧，我把原子替換看看～～ 2010-05-29 21:24:34
lvjian8596(金幣+1):感謝交流！鼓勵(lì)發(fā)有價(jià)值的話題！ 2010-06-22 22:23:49
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這個(gè)收斂參數(shù)沒有問題，200meV。 MeshCutoff=150.Ry 你在看一下其他參數(shù)。 還有可能就是體系的問題，同樣結(jié)構(gòu)的BN比Graphene就會(huì)要難收斂好多，體系完全一樣，把原子替換成BN之后 計(jì)算量是Graphene的好幾倍 |
3樓2010-05-29 18:45:14
zhangguangping
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5樓2010-06-08 21:30:32
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