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mafei028銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】固體的紅外吸收譜能不能算啊 已有3人參與
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如題。如果能算，要用什么算？ [ Last edited by wuli8 on 2010-5-31 at 20:41 ] ？ [ Last edited by mafei028 on 2011-8-21 at 10:58 ] |
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2樓2010-05-31 19:26:32
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3樓2010-05-31 20:06:07
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很多第一性原理分子動力學軟件可以計算。 因為紅外吸收是電磁波與周期性振動的dipole moment產(chǎn)生的電磁場相互作用產(chǎn)生的，因此，只要獲得你這個固體體系的dipole moment隨時間變化的軌跡，然后做自相關(guān)函數(shù)的傅立葉變化，即可將時間-dipole信號，轉(zhuǎn)變?yōu)轭l率-吸收強度信號。 要獲得dipole moment隨時間變化的軌跡，可以使用CPMD, cp2k等基于DFT密度泛函的分子動力學模擬軟件，生成一個大約20ps-40ps的動力學軌跡，每個運動步計算體系的dipole moment即可得到dipole軌跡。注意1.這里的體系dipole moment并非每個分子的dipole moment，而是整個模擬體系的dipole moment，它的周期性變化包含了各個基團的振動對總dipole moment的貢獻； 2.準確計算體系dipole是關(guān)鍵，要選取合適的電子相關(guān)處理方法（廣域梯度近似GGA比局域密度近似LDA要好，因為dipole計算需要準確的電子密度的梯度信息）和合適的交換相關(guān)泛函(PBE, BLYP, BP)，并測試所用的贗勢。 得到體系dipole的演化軌跡以后，即可計算其自相關(guān)函數(shù)的傅立葉變化，可將時域信號轉(zhuǎn)換成頻域信號，而頻域信號的傅立葉變化在整個時間上的積分則可以得到在各頻率上的吸收強度。具體理論可以參考文獻：CPMD計算IR spectrum, M.P. Gaigeot, JCTC, 1, 772-789, 2005 推薦你使用CPMD，關(guān)于dipole軌跡的自相關(guān)-傅立葉變化的處理見： http://groups.google.ca/group/cp ... ad/a6a15953029189f9 |
4樓2010-06-01 05:02:29
mafei028
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5樓2010-06-01 11:45:25
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