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maoxiaoming銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
【求助】環(huán)糊精包合物的分子模擬 已有13人參與
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我前段時間做了一些環(huán)糊精包合物方面的研究,對包合物進行了一些表征,但所做的分析討論太過淺顯。 想試著做些分子模擬方面的探討。但在分子模擬方面什么也不懂。 想請問一下:一般做包合物的分子模擬用什么軟件比較好? 有沒有相關的文獻資料推薦?因為這方面的軟件一點都不會。 對電腦的配置有些什么要求? 謝謝!謝謝!謝謝! [ Last edited by maoxiaoming on 2010-6-10 at 13:18 ] |
銅蟲 (初入文壇)
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作為一個過來人,說兩句話。 我也做實驗和模擬。不知道你要做到什么程度,從時間上看,我建議你暫時不要去碰gromacs和namd,學習Material Studio/DS比較適合你,原因有二: 1)這兩個專用于模擬,是計算專業(yè)戶吃飯的家伙。需要一定時間掌握,對體系要有很好的了解,不是一切默認能搞定問題的。這兩者都只是MD代碼,對于標準立場未參數(shù)化的化合物一樣無能為力,參數(shù)化一套東西,花個1年很正常,特別要是分子大一點。如果走這條路,你要準備至少2年空白時間(。。。。。不知道你有沒有 2)MS/DS是鼠標操作,比較傻。。。一般實驗數(shù)據(jù)配套簡單的電子結構,能級或者簡單的MD,熱力學量分析(這些現(xiàn)在版本的MS/DS都能做),足矣~ 僅供參考 |
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