 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3048 | 回復(fù): 18 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
【請(qǐng)教】請(qǐng)教一下關(guān)于空間群的問(wèn)題. 已有7人參與
|
|||
|
我有一個(gè)晶體, 晶胞參數(shù)有兩個(gè)接近90度, 但只是接近,其中的一個(gè)是87度多, 程序默認(rèn)是三斜, P-1空間群. 按此解出的結(jié)構(gòu)中有兩個(gè)分子. 晶胞PACK后,一個(gè)晶胞里面有四個(gè)分子, 那么這樣Z值是不是應(yīng)該為2? 但是CHECK的時(shí)候, 系統(tǒng)給出的是Z=4, 也沒有提示有空間群的錯(cuò)誤. 是網(wǎng)上的CHECK不能夠辨認(rèn)2個(gè)分子為一個(gè)單位?還是暗示我的空間群定得有問(wèn)題? 另外有人建議我按單斜解, 就是把那兩個(gè)接近90度的當(dāng)成90度. 這樣程序給P21/C空間群. 按此也能解出結(jié)構(gòu), 為一個(gè)分子. 但是按此空間群解的時(shí)候Rint值很大, 達(dá)到0.233. 里面有一些原子溫度因子很大. 我的數(shù)據(jù)不好, 兩者解出來(lái)的R值都很大, R1有0.14, 我應(yīng)該如何確定我的空間群(PLATON對(duì)兩個(gè)空間群都沒有提示需要改變). [ Last edited by triiawypm on 2010-6-25 at 09:40 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0703化學(xué)26考研調(diào)劑，一志愿南昌大學(xué)
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
有沒有化學(xué)、材料專業(yè)的同學(xué)需要調(diào)劑 考慮天津高效的可以郵件或者私信
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
無(wú)機(jī)化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有265人回復(fù)
-
26年博士招生
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
江西理工大學(xué)功能晶態(tài)材料方向劉遂軍課題組招收2026年秋季入學(xué)博士研究生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
寧夏大學(xué)團(tuán)簇新材料團(tuán)隊(duì)招收材料/化學(xué)/化工專業(yè)博士生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
MIL-101有單晶樣品嗎
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
已刪除
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
收調(diào)劑研究生
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
【2026 考研調(diào)劑】哈爾濱工程大學(xué)核科學(xué)與技術(shù)學(xué)院核化工系 招收調(diào)劑生
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
武漢紡織大學(xué)技術(shù)研究院招收化學(xué)、化工、生物、材料、紡織等背景專業(yè)調(diào)劑生
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 請(qǐng)教一個(gè)空間群的問(wèn)題，謝謝蟲子了。
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】向大俠請(qǐng)教，已知空間群，并且已經(jīng)有粉末衍射數(shù)據(jù)，怎么確定原子位置？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】空間群?jiǎn)栴}求教
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】CIF文件中一個(gè)關(guān)于手性空間群的法拉克常數(shù)為負(fù)值的問(wèn)題？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】如何確定晶體的晶胞參數(shù)及空間點(diǎn)群？先謝過(guò)！
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】為什么我用planton升高空間群，不產(chǎn)生planton.ins文件
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】ICSD中的空間群
已經(jīng)有18人回復(fù)
bamboo1109
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 10195.6
- 散金: 3585
- 紅花: 19
- 帖子: 2350
- 在線: 1107.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 603118
- 注冊(cè): 2008-09-15
- 專業(yè): 天然有機(jī)化學(xué)
7樓2010-06-12 08:16:29
gxsddxj
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 15 (小學(xué)生)
- 金幣: 3190.2
- 紅花: 4
- 帖子: 811
- 在線: 270.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 409601
- 注冊(cè): 2007-06-22
- 性別: MM
- 專業(yè): 無(wú)機(jī)材料化學(xué)
★
triiawypm(金幣+10):非常感謝. 不是手性空間群也會(huì)出現(xiàn)absolute structure的那個(gè)問(wèn)題嗎?Flack參數(shù)在什么位置可以看到? 2010-06-11 22:46:04
wsht212(金幣+1):謝謝交流，希望常來(lái)！ 2010-06-11 22:52:30
triiawypm(金幣+10):非常感謝. 不是手性空間群也會(huì)出現(xiàn)absolute structure的那個(gè)問(wèn)題嗎?Flack參數(shù)在什么位置可以看到? 2010-06-11 22:46:04
wsht212(金幣+1):謝謝交流，希望常來(lái)！ 2010-06-11 22:52:30
|
精修的過(guò)程當(dāng)中出現(xiàn)提示: absolute structure probaly wrong: invert and repeat refinement , 可以試試 MOVE 1 1 1 -1。Flack參數(shù)一般只有手性空間群才有。 XP里面是不是沒有刪掉某個(gè)鍵的命令是undo 加原子名稱 ins文件中原子個(gè)數(shù)應(yīng)該包括溶劑 |
5樓2010-06-11 22:19:44
lanmao20
金蟲 (正式寫手)
- CMEI: 2
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1247.9
- 紅花: 1
- 帖子: 343
- 在線: 45.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 438310
- 注冊(cè): 2007-09-20
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)化學(xué)
★ ★ ★ ★
triiawypm(金幣+8):謝謝, 還有一些問(wèn)題. 2010-06-12 10:44:20
wsht212(金幣+4):謝謝交流，希望常來(lái)！ 2010-06-12 13:20:22
triiawypm(金幣+8):謝謝, 還有一些問(wèn)題. 2010-06-12 10:44:20
wsht212(金幣+4):謝謝交流，希望常來(lái)！ 2010-06-12 13:20:22
|
1. 配位的茂環(huán)是不是不能用XSHELL加氫?因?yàn)樯厦骘@示了三個(gè)鍵了.我只會(huì)用XP 照理來(lái)說(shuō)是應(yīng)該可以的，但是有的時(shí)候也許你的環(huán)不好，所以不能理論加上去？這個(gè)時(shí)候可以限制一下環(huán)，然后再進(jìn)行理論加氫，可能會(huì)好一點(diǎn)。 2. 精修的過(guò)程當(dāng)中出現(xiàn)提示: absolute structure probaly wrong: invert and repeat refinement , 這意味著是手性空間群?jiǎn)?這里面涉及到什么Flack參數(shù)嗎?從哪里能找到它? 樓上已經(jīng)有人解答這個(gè)問(wèn)題了，就不贅述了，flack參數(shù)在cif文件中可以看到。 3. 我的化合物里面有一分子的THF, 如何能確定哪個(gè)是O啊? 看著鍵長(zhǎng)一點(diǎn)兒都沒有規(guī)律呢. 鍵長(zhǎng)沒有規(guī)律時(shí)，可以仔細(xì)觀察溫度因子，異常的溫度因子會(huì)反映很多問(wèn)題，譬如溫度因子過(guò)小可以考慮此處的原子應(yīng)該是一個(gè)更重的原子，反之亦然。 4. 通過(guò)原子坐標(biāo)能看出某個(gè)原子是否已經(jīng)進(jìn)行過(guò)各向異性精修嗎? 如何對(duì)所有的非氫原子進(jìn)行各向異性精修(通過(guò)改INS的方式), anis后面加啥東西? 是說(shuō)ins文件中的坐標(biāo)嗎？打開ins文件后，坐標(biāo)后面的11.0000后面如果只有一個(gè)數(shù)字，那還沒有做各向異性，如果有6個(gè)數(shù)字，就說(shuō)明做了。對(duì)非氫原子做我想可以用anis $O $C $N。。。等。 以上僅供參考。。。 |
8樓2010-06-12 09:40:50
★ ★
帝夫(金幣+2):謝謝回帖交流~ 2010-06-12 17:13:24
帝夫(金幣+2):謝謝回帖交流~ 2010-06-12 17:13:24
|
1. XSHELL里面, 茂環(huán)的每個(gè)原子都與金屬有連接鏈, 這樣每原子也就是已經(jīng)存在三個(gè)鍵了. 在hybridize all 之后, 程序自動(dòng)認(rèn)定為SP3的C, 這樣如果加氫那就位置不對(duì)了啊.如果手動(dòng)改成SP2的話,那三個(gè)鍵就已經(jīng)滿了, 要如何加呢? 2. absolute structure probaly wrong: invert and repeat refinement , 這意味著是手性空間群?jiǎn)? 3. 最后一行應(yīng)該是溫度因子.幫忙看一下我定的是不是對(duì)呢? 好像都挺大的. C105 --- C 0.087 0.118 0.836 sp3 0 0.178 C100 --- C 0.095 0.258 0.764 sp3 0 0.077 O4 --- O 0.113 0.151 0.795 sp3 0 0.139 C103 --- C 0.076 0.333 0.818 sp3 0 0.179 C102 --- C 0.062 0.214 0.861 sp3 0 0.148 4. P2 4 0.82841 0.26287 0.22987 11.00000 0.01921 0.02084 = 0.02339 0.00022 -0.00075 0.00058 這個(gè)就是后面有六個(gè)數(shù)字,已經(jīng)修過(guò)了唄? |
9樓2010-06-12 10:53:00
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +10 | 鈕恩雪 2026-03-25 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 崔wj 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑，求導(dǎo)師收 +9 | 天天好運(yùn)來(lái)上岸?/a> 2026-03-24 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +7 | 江辭666 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)學(xué)碩，一志愿湖南大學(xué)，初試成績(jī)338 +6 | YYYYYNNNNN 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 071000生物學(xué)求調(diào)劑，初試成績(jī)343 +7 | 小小甜面團(tuán) 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿華北電力大學(xué)能動(dòng)專碩，293，求調(diào)劑 +3 | 15537177284 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +4 | 26要上岸 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 272求調(diào)劑 +7 | 腳滑的守法公民 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 08開頭275求調(diào)劑 +4 | 拉誰(shuí)不重要 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +5 | 哇盧卡庫(kù) 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +4 | 我真的很想學(xué)習(xí) 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)一志愿南京師范大學(xué)303求調(diào)劑 +3 | zzffylgg 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 325求調(diào)劑 +5 | 李嘉圖·S·路 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料考研求調(diào)劑 +3 | Dendel 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0854AI CV方向招收調(diào)劑 +4 | 章小魚567 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0854電子信息求調(diào)劑 324 +4 | Promise-jyl 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | plum李子 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 085404電子信息284分求調(diào)劑
+4
|
13659058978 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 336化工調(diào)劑 +4 | 王大坦1 2026-03-23 | 5/250 |
|