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lovemydog銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】計(jì)算振動(dòng)模式 已有6人參與
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想研究一下分子的振動(dòng)模式，得到其各個(gè)原子的振動(dòng)頻率和振幅，請(qǐng)問一下是不是用Dmol3對(duì)其進(jìn)行幾何優(yōu)化時(shí)，性質(zhì)里勾選“frequency”，這個(gè)得到的頻率能相應(yīng)的對(duì)應(yīng)到各個(gè)原子么？如果對(duì)應(yīng)不到該選用那個(gè)模塊進(jìn)行計(jì)算？另外分子中原子的振幅該怎么算？通過紅外譜圖么？ 先謝謝大家了 |
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hedaors(金幣+1):Thanks 2010-06-25 18:54:47
lovemydog(金幣+3): 2010-06-26 09:14:33
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
hedaors(金幣+1):Thanks 2010-06-25 18:54:47
lovemydog(金幣+3): 2010-06-26 09:14:33
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性質(zhì)勾選Frequency， 之后在tools -> vibrational Analysis可以得到紅外光譜以及各個(gè)模式的振動(dòng)情況。 振動(dòng)幅度可以在option里面設(shè)置，是人為控制的一個(gè)參數(shù)。 紅外光譜的強(qiáng)度在vibrational Analysis里面可以直接得到。 |
3樓2010-06-25 18:45:19
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2樓2010-06-25 15:18:44
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4樓2010-06-26 09:16:28
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5樓2010-06-26 16:28:41
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6樓2010-06-27 18:21:45
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7樓2010-06-28 09:29:36
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8樓2010-06-29 08:58:01
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9樓2010-06-29 09:01:20
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lovemydog(金幣+1): 謝謝參與
franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流，， 2013-07-01 23:55:20
lovemydog(金幣+1): 謝謝參與
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我用Dmol計(jì)算氨基酸晶胞的振動(dòng)，只得到了頻率，沒有強(qiáng)度。看了http://www.gaoyang168.com/html/201012/2718325.html，但是對(duì)于如何計(jì)算偶極矩導(dǎo)數(shù)矩陣還是不太清楚。晶體的振動(dòng)強(qiáng)度你了解怎么手動(dòng)計(jì)算嗎 |
10樓2013-07-01 09:42:19
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