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[交流]
【求助】關(guān)于復(fù)雜的結(jié)構(gòu)參數(shù)的優(yōu)化 已有3人參與
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在侯柱峰老師的文章中看到有這么一句話(《VASP入門指南》-page25):得到E-V曲線后,通過狀態(tài)方程擬合得到平衡狀態(tài)下的體積,計算出腳本中變量i的值。這個怎么計算啊??? 并改變i的循環(huán)值,這個是什么意思,具體是怎么操作的??? 再次運行run_cell計算一次,得到其他結(jié)構(gòu)參數(shù)c和位置u。。。這個從哪里可以看出?或者怎樣能夠得到?? (腳本為書中例子): #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71 do cat > POSCAR < Mg-hex $i 0.0 -1.0 0.0 0.8660254037844 0.5 0.0 0.0 0.0 1.6230529595 2 Direct 0.6666666666666667 0.3333333333333333 0.750 0.3333333333333333 0.6666666666666667 0.250 ! cp INCAR.relax INCAR echo "a = $i angstrom " ; time vasp cp CONTCAR POSCAR cp INCAR.static INCAR echo "a = $i angstrom " ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ V=‘grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.4f \n", $5 }’‘ echo $V $E >>EtVo.dat done [ Last edited by qiqi2926 on 2010-6-26 at 14:02 ] |
禁蟲 (正式寫手)
隱清堂主
禁蟲 (正式寫手)
隱清堂主
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for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71 這個語句是一個循環(huán),每改變一個 i 值,做一個計算。 你沒用過 Linux ? 你需要下功夫補補 Linux 的 Shell 腳本知識了,用 VASP 必須要會的。 這有個不錯的教程: http://tldp.org/LDP/abs/html/ 也可一看看中文版 http://wenku.baidu.com/view/ab2cfe21dd36a32d73758196.html |
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在小木蟲上搜murn.f程序,用來擬合晶格常數(shù),具體的用法就在侯老師那本書的后面。 擬合出來晶格常數(shù)的值(即i的值)后,在做一次結(jié)構(gòu)弛豫即INCAR.relax便可得到其他結(jié)構(gòu)參數(shù)的值了,具體怎么得到要依據(jù)晶胞的結(jié)構(gòu)特征。不知我這樣理解是否正確,還請高手指點,僅供樓主參考,共同學(xué)習(xí)! |
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