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qiqi2926銅蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】關(guān)于復(fù)雜的結(jié)構(gòu)參數(shù)的優(yōu)化 已有3人參與
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在侯柱峰老師的文章中看到有這么一句話（《VASP入門指南》-page25）：得到E-V曲線后，通過狀態(tài)方程擬合得到平衡狀態(tài)下的體積，計(jì)算出腳本中變量i的值。這個(gè)怎么計(jì)算��？？？ 并改變i的循環(huán)值，這個(gè)是什么意思，具體是怎么操作的？？？ 再次運(yùn)行run_cell計(jì)算一次，得到其他結(jié)構(gòu)參數(shù)c和位置u。。。這個(gè)從哪里可以看出？或者怎樣能夠得到？？ （腳本為書中例子）： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71 do cat > POSCAR < Mg-hex $i 0.0 -1.0 0.0 0.8660254037844 0.5 0.0 0.0 0.0 1.6230529595 2 Direct 0.6666666666666667 0.3333333333333333 0.750 0.3333333333333333 0.6666666666666667 0.250 ! cp INCAR.relax INCAR echo "a = $i angstrom " ; time vasp cp CONTCAR POSCAR cp INCAR.static INCAR echo "a = $i angstrom " ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ V=‘grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.4f \n", $5 }’‘ echo $V $E >>EtVo.dat done [ Last edited by qiqi2926 on 2010-6-26 at 14:02 ] |
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2樓2010-06-26 13:04:56
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3樓2010-06-26 14:03:48
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gavinliu7390(金幣+2):謝謝交流！ 2010-06-26 15:22:42
cenwanglai(金幣+1):恩,費(fèi)心了! 2010-06-26 19:33:51
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for i in 2.81 2.91 3.01 3.11 3.21 3.31 3.41 3.51 3.61 3.71 這個(gè)語句是一個(gè)循環(huán)，每改變一個(gè) i 值，做一個(gè)計(jì)算。 你沒用過 Linux ? 你需要下功夫補(bǔ)補(bǔ) Linux 的 Shell 腳本知識(shí)了，用 VASP 必須要會(huì)的。 這有個(gè)不錯(cuò)的教程: http://tldp.org/LDP/abs/html/ 也可一看看中文版 http://wenku.baidu.com/view/ab2cfe21dd36a32d73758196.html |
4樓2010-06-26 14:20:28
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cenwanglai(金幣+1):呵呵,直接用二次曲線擬合得到i就可以了. 2010-06-26 19:34:27
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cenwanglai(金幣+1):呵呵,直接用二次曲線擬合得到i就可以了. 2010-06-26 19:34:27
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在小木蟲上搜murn.f程序，用來擬合晶格常數(shù)，具體的用法就在侯老師那本書的后面。 擬合出來晶格常數(shù)的值（即i的值）后，在做一次結(jié)構(gòu)弛豫即INCAR.relax便可得到其他結(jié)構(gòu)參數(shù)的值了，具體怎么得到要依據(jù)晶胞的結(jié)構(gòu)特征。不知我這樣理解是否正確，還請高手指點(diǎn)，僅供樓主參考，共同學(xué)習(xí)！ |
5樓2010-06-26 17:15:10
qiqi2926
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6樓2010-06-28 09:33:59
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