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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » MS » 【原創(chuàng)】分子篩建模
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[交流]
【原創(chuàng)】分子篩建模 已有3人參與
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MS里面自帶了很多分子篩，但是假如需要得到像MCM-41這樣的,MS里面沒有的分子篩該怎么辦？那就得自己建了，以下是主要步驟。 1. File->Import->Material studio4.3/share/structures/glasses/SiO2_21A.3d.msi。 2. Build->Symmetry->Supercell->輸入A,B,C數(shù)值（比如說3*7*2）->按“Create supercell”。 3. Edit->Atom Selection->Select by property,然后在下拉菜單中選擇“Radial Distance”->Within->10A(挖孔的直徑，可以根據(jù)不同實驗的文獻有所變動)->Relative to->location->輸入坐標（如21.42,21.42,0）。Selection mode選擇第一個->select->右鍵delete(每次在z 方向推進2A，這樣在慢慢推進后就會挖出一個圓孔)。然后根據(jù)MCM-41的六方結構，通過幾何規(guī)則確定其他的圓心，按照以上方法挖出孔道。 4. 點擊“Adjust Hydrogen”(H)為挖空后的Si補齊電荷。 5. Edit->Atom Selection->Select by property下拉菜單中選擇Element->選擇Si->Selection mode下選擇第一個->點擊Select->Select by property下拉菜單中選擇 connected-> Selection mode下選擇第一個->點擊 Select-> Select by property下拉菜單中選擇 element->選擇H-> Selection mode下選擇第二個->點擊Select->Modify->Modify element->oxygen->點擊“Adjust Hydrogen”。 6. Edit->Find patterns找出孔壁上連有3個-OH的Si,將該結構刪除，再補足H原子，完成后的MCM-41結構如圖1所示，還需要分子動力學優(yōu)化才能使用Sorption模塊或者其他的GCMC軟件進行GCMC模擬。 |
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 分子篩 | MCM-41 |
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3樓2015-12-09 10:59:41
2樓2010-07-01 08:48:39
zxhuizhang
木蟲 (正式寫手)
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4樓2019-10-08 17:51:33
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