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bbslover金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【討論】如何批量更改sybyl mol2分子格式的內部外部名稱？ 已有6人參與
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如何批量更改sybyl mol2分子格式的內部外部名稱？ 開始使用chemdraw畫分子的時候，都命名以數(shù)字開頭的了，比如1.cdx 2.cdx .... 200.cdx,現(xiàn)在做藥效團疊合的時候不識別了，可能是分子名稱不對，似乎分子命名時候以字母開頭比較好，比如m1.cdx m2.cdx...m200.cdx,轉化到mol2后，分子內部名稱是1.cdx.mol2, 2.cdx.mol2, ... 200.cdx.mol2，我想把這200個分子批量改名內部外部都命名為m1.mol2, m2.mol2...m200.mol2，請問有什么辦法可以批量更改這個數(shù)據(jù)庫中的200各分子嗎，或者更改包括多分子的sdf，multimol2文件都行，謝謝！一個一個命名太費時了。 謝謝！ |
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多謝回答，但是更改的是文件的外部顯示名稱，內部的還是沒有改變啊。比如，我的 101.mol2，要改為m101.mol2. 我重新命名之后，內部顯示的還是101.mol2,內部沒有改變，到sybyl中識別的是內部名稱的。 # Name: 101 # Creating user name: hm # Creation time: Thu Jul 8 02:37:16 2010 # Modifying user name: hm # Modification time: Thu Jul 8 02:37:16 2010 @ 101 58 61 1 1 1 SMALL GAST_HUCK **** From 3DB ct @ 1 C -0.052516 0.333430 -0.461461 C.ar 1 <1> 0.131981 2 C -0.202692 -0.038602 0.878834 C.ar 1 <1> 0.107916 3 C 0.936281 -0.092950 1.694546 C.ar 1 <1> 0.022827 4 C 2.199129 0.136481 1.133930 C.ar 1 <1> 0.022908 5 N 2.309747 0.414917 -0.181321 N.ar 1 <1> -0.307302 6 C 1.227881 0.556571 -0.972923 C.ar 1 <1> 0.021080 |
7樓2010-07-11 12:19:13
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+4):謝謝 2010-07-12 13:38:43
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+4):謝謝 2010-07-12 13:38:43
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用EditPlus（共享）或者CrimsonEditor（開源/免費）這樣的文本編輯軟件。 Edit菜單下，有類似Find in files之類的功能， 也就是對某目錄下的多個文件的內容進行“查找、修改”。 一般是用于編程時，改變某個變量的名稱，這個名稱往往分布在多個源代碼文件中。 如果是簡單的“替換”，那還比較容易。 如果類似您這種情況，那還要用到“正則表達式” ------------ 有個取巧的辦法： 即把 # Name: 1 替換為 # Name: m1 ----------- 話說回來，用文本編輯器，修改200個文件的內容，手工操作，10分鐘而已。 |
8樓2010-07-11 14:24:28
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