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wexondft金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【原創(chuàng)】MS的過渡態(tài)搜索方法不合理！ 已有12人參與
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MS的的DMol和CASTEP模塊中提供的LST/QST搜索過渡態(tài)的方法不合理！ 其利用RMS的收斂標(biāo)準(zhǔn)不能保證每個原子上的力都收斂，也就是無法滿足鞍點的要求。 因此用LST/QST方法找過渡態(tài)一定要小心，通常得到的能壘是高估的。 在DMol中最好用Eigenvector following找過渡態(tài)！��！ 歡迎討論！ |
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fzx2008: 金幣+3, 謝謝指教！ 2012-11-20 20:54:18
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fzx2008: 金幣+3, 謝謝指教！ 2012-11-20 20:54:18
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不敢同意。LST/QST計算完了之后為什么還要生成Hessian矩陣并再進(jìn)行ts optimization呢？就是為了看看生成的過渡態(tài)是否確實只有一個大虛頻的。RMS對于勢能面的一階鞍點與局域最小點都是有效的判斷方式。 EF方法的最大問題在于EF法是只基于反應(yīng)物結(jié)構(gòu)搜索過渡態(tài)的算法，因此需要對過渡態(tài)有一個合理的初猜，否則難以判斷哪個振動模式對應(yīng)反應(yīng)路徑。另外，即使你不對過渡態(tài)結(jié)構(gòu)有任何初猜而放任其徹底從頭尋找，那么反應(yīng)物結(jié)構(gòu)生成Hessian矩陣后，一樣很難判斷究竟哪一個頻率對應(yīng)反應(yīng)路徑。雖然理論上一般認(rèn)為反應(yīng)路徑在勢能面比較平緩的區(qū)域，因此最小的那個頻率對應(yīng)反應(yīng)路徑，但現(xiàn)實計算中早已發(fā)現(xiàn)大部分情況都不是這樣。選取最小的頻率進(jìn)行優(yōu)化往往得不到任何結(jié)果。 |
18樓2012-11-20 19:42:55
★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lvjian8596(金幣+3):感謝交流！ 2010-07-07 22:25:48
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DMol中找過渡態(tài)要 先用TS Search - searches for a transition state using linear synchronous transit (LST) and quadratic synchronous transit (QST) methods 再進(jìn)行 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 最后再 TS Confirmation - produces a refined reaction path based on an LST or QST search |
2樓2010-07-07 22:09:22
cmwangdft
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3樓2010-07-07 23:10:55
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請問您說的 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 具體是怎么操作的啊？我先是TS Search（同時計算頻率）找到了一個過渡態(tài)，然后該怎么操作呢？ 提示：In order to perform a TS Optimization caculation, a Hessian matrix must be present in the model.A Hessian matrix can be generated by running a frequency calculation on the model.Alternatively, a valid Hessian matrix can be imported.Once a Hessian is present, a normal mode should then be selected. 其中所提到的model是指哪個呢？ |
4樓2010-07-08 09:55:38
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