版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請(qǐng)盡快對(duì)帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜

返回列表

zjz660964

鐵蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 6.6
帖子: 15
在線: 12.9小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1010307
注冊(cè): 2010-05-03
專業(yè): 分子對(duì)接

[交流] 【討論】如何進(jìn)行小分子結(jié)構(gòu)文件格式的轉(zhuǎn)化已有4人參與

有些格式的小分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)文件可以包含多個(gè)小分子，比如mol2和sdf文件等。那么這些包含多個(gè)分子的小分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)文件之間如何進(jìn)行格式轉(zhuǎn)化呢？比如sdf和mol2之間如何轉(zhuǎn)換。還有如何對(duì)進(jìn)行這些多分子文件進(jìn)行拆分和組合呢？謝謝大家啦。

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

281求調(diào)劑（0805）已經(jīng)有8人回復(fù)
環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名已經(jīng)有3人回復(fù)
材料專碩306英一數(shù)二已經(jīng)有10人回復(fù)
301求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)
302求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
26博士申請(qǐng) 已經(jīng)有3人回復(fù)
268求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
311求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)
被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開(kāi)始管格式了已經(jīng)有4人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

怎么驗(yàn)證我轉(zhuǎn)化成功呀已經(jīng)有16人回復(fù)
如何用MS的納米管坐標(biāo)轉(zhuǎn)到gromacs可識(shí)別的文件已經(jīng)有7人回復(fù)
【ME】分子格式轉(zhuǎn)化小程序convert0.2 已經(jīng)有31人回復(fù)
怎么通過(guò)perl語(yǔ)言將很多xsd文件一次性轉(zhuǎn)化為mol文件呢？已經(jīng)有4人回復(fù)
如何做一個(gè)小分子化合物與蛋白結(jié)構(gòu)的Binding 已經(jīng)有11人回復(fù)
請(qǐng)問(wèn)在做藥物分子對(duì)接時(shí)藥物分子結(jié)構(gòu)文件的準(zhǔn)備已經(jīng)有9人回復(fù)
【求助】問(wèn)如何選擇基組精確計(jì)算有機(jī)小分子結(jié)構(gòu)和能量的問(wèn)題已經(jīng)有5人回復(fù)
【求助】將MS數(shù)據(jù)文件轉(zhuǎn)化成lammps data 已經(jīng)有25人回復(fù)

1樓 2010-07-10 18:42:53

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

fmtzhangli

金蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 1311.3
紅花: 1
帖子: 73
在線: 132.5小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 908286
注冊(cè): 2009-11-20
專業(yè): 生物信息學(xué)

★ ★
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+1):謝謝 2010-07-12 13:41:21

用openbabel轉(zhuǎn)換格式

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

2樓2010-07-11 10:42:16

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tjegg

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
金幣: 6869.3
紅花: 16
帖子: 2615
在線: 448小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 338983
注冊(cè): 2007-04-05
性別: GG
專業(yè): 抗腫瘤藥物藥理

★ ★
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+1):謝謝 2010-07-12 13:41:30

這個(gè)問(wèn)題，已經(jīng)被回答了無(wú)數(shù)遍了，LZ如果勤快點(diǎn)，學(xué)會(huì)用站內(nèi)搜索，很簡(jiǎn)單。省得動(dòng)不動(dòng)就求助，還沒(méi)有人搭理氣惱。

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

除了你的親人，沒(méi)有人應(yīng)該對(duì)你好，對(duì)你好的人，一定要珍惜。

3樓2010-07-11 15:43:02

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

yalefield

金蟲(chóng) (文壇精英)

老漢一枚

模擬EPI: 1
應(yīng)助: 129 (高中生)
貴賓: 0.17
金幣: 21238.9
散金: 3440
紅花: 66
帖子: 12101
在線: 759.1小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 96063
注冊(cè): 2005-10-07
專業(yè): 高等教育學(xué)
管轄: 計(jì)算模擬

★ ★
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+1):謝謝 2010-07-12 13:41:37

看看Gasteiger的《化學(xué)信息學(xué)簡(jiǎn)明教程》，就感到實(shí)在不好意思了。

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

4樓2010-07-11 17:32:46

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

zjz660964

鐵蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 6.6
帖子: 15
在線: 12.9小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1010307
注冊(cè): 2010-05-03
專業(yè): 分子對(duì)接

是這樣的，我用openbabel轉(zhuǎn)了，但包含的分子數(shù)太多，根本沒(méi)法轉(zhuǎn)。

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2010-07-11 19:06:18

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

zjz660964

鐵蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 6.6
帖子: 15
在線: 12.9小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1010307
注冊(cè): 2010-05-03
專業(yè): 分子對(duì)接

我的單個(gè)mol2文件包含差不多四萬(wàn)多個(gè)分子，一跑就死機(jī)。

贊一下

回復(fù)此樓

6樓2010-07-11 19:12:56

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

fmtzhangli

金蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 1311.3
紅花: 1
帖子: 73
在線: 132.5小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 908286
注冊(cè): 2009-11-20
專業(yè): 生物信息學(xué)

★ ★ ★
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-09-01 10:00:12

引用回帖:

Originally posted by zjz660964 at 2010-07-11 19:12:56:
我的單個(gè)mol2文件包含差不多四萬(wàn)多個(gè)分子，一跑就死機(jī)。

linux上命令運(yùn)行不會(huì)死機(jī)吧
win上不知道能不能命令運(yùn)行。。。

贊一下(2人)

回復(fù)此樓

7樓2010-08-31 22:09:48

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn) 我要訂閱樓主 zjz660964 的主題更新

返回列表

普通表情龍兔虎貓高級(jí)回復(fù) (可上傳附件)

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]		作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 304求調(diào)劑 +8	小熊joy 2026-03-14	8/400	2026-03-17 17:29 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程專碩調(diào)劑 +5	204818@lcx 2026-03-17	5/250	2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 26考研求調(diào)劑 +6	丶宏Sir 2026-03-13	6/300	2026-03-17 16:13 by 醉在風(fēng)里
[碩博家園] 深圳大學(xué)碩士招生（2026秋，傳感器方向，僅錄取第一志愿） +4	xujiaoszu 2026-03-11	9/450	2026-03-17 10:29 by xujiaoszu
[考研] 考研調(diào)劑 +3	淇ya_~ 2026-03-17	5/250	2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 機(jī)械專碩調(diào)劑 +3	笨笨兔子 2026-03-12	3/150	2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 294求調(diào)劑 +3	Zys010410@ 2026-03-13	4/200	2026-03-15 10:59 by zhq0425
[基金申請(qǐng)] 有必要更換申報(bào)口嗎 20+3	fannyamoy 2026-03-11	3/150	2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 304求調(diào)劑 +6	Mochaaaa 2026-03-12	7/350	2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 材料工程調(diào)劑 +9	咪咪空空 2026-03-12	9/450	2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 求材料調(diào)劑 +5	隔壁陳先生 2026-03-12	5/250	2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] ［0860］321分求調(diào)劑，ab區(qū)皆可 +4	寶貴熱 2026-03-13	4/200	2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交大，材料專碩317求調(diào)劑 +5	lx8568 2026-03-11	5/250	2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 304求調(diào)劑 +7	7712b 2026-03-13	7/350	2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 329求調(diào)劑 +3	miaodesi 2026-03-12	4/200	2026-03-13 20:53 by 18595523086
[考研] 311求調(diào)劑 +3	冬十三 2026-03-13	3/150	2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 【考研調(diào)劑求收留】 +3	Ceciilia 2026-03-11	3/150	2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 求調(diào)劑 +5	一定有學(xué)上- 2026-03-12	5/250	2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 314求調(diào)劑 +7	無(wú)懈可擊的巨人 2026-03-12	7/350	2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 274求調(diào)劑 +3	S.H1 2026-03-12	3/150	2026-03-13 15:15 by JourneyLucky

24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜

[交流] 【討論】如何進(jìn)行小分子結(jié)構(gòu)文件格式的轉(zhuǎn)化 已有4人參與

» 猜你喜歡

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

[交流] 【討論】如何進(jìn)行小分子結(jié)構(gòu)文件格式的轉(zhuǎn)化已有4人參與

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助: