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ckm840529鐵桿木蟲 (著名寫手)
I love science!
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[交流]
【求助】蛋白質(zhì)近表面靜電勢能模擬 已有2人參與
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| 長期基于實驗工作，目前需要補充一些相關(guān)的模擬工作，主要是對蛋白質(zhì)在不同溶劑環(huán)境（如鹽濃度，pH）中的表面及近表面的靜電勢能做模擬分析。找到了可能的模擬軟件為DelPhi和Pymol，但是小弟不才，很難入門。不知各位大蝦有沒有涉及這方面的工作，或者還有什么其他的模擬軟件可以實現(xiàn)模擬表面靜電勢能呢？感謝你們的賜教。 |
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雪狼乖乖 
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2樓2010-07-18 20:20:54
ckm840529
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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3樓2010-07-18 23:21:57
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-07-19 09:55:43
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-07-19 09:55:43
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你說的是另一個問題 Poisson-Boltzmann方程一般是用于電子遷移率的計算上 國內(nèi)有人用的 建議你去閱覽帥志剛、王曙光老師的工作 他們在計算靜電勢能時 考慮了原子核的影響 PyMOL_APBS 這個軟件確實是可以計算靜電勢能的 馬路 周果宏 （首都醫(yī)科大的）曾經(jīng)寫過關(guān)于DelPhi的計算 但都沒有涉及關(guān)于PH值的計算 Poisson-Boltzmann方程 我不太了解是否能用于蛋白質(zhì)的計算 希望你閱讀了帥老師的工作 能有啟發(fā) |
4樓2010-07-19 08:33:10
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