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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 材料區(qū) » 晶體 » 晶體解析 » 【求助】pi-pi作用如何寫入cif
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[交流]
【求助】pi-pi作用如何寫入cif 已有5人參與
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編輯給了如下修改意見，請問大蝦們我該怎么做啊? 我知道編輯的意思，只是and前的那部分不知具體怎么辦？ The 3 weak Cg-Cg intermolecular interactions need to be listed in a separate table and referred to in the discussion in the comment section. |
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2樓2010-08-08 21:13:59
fmopily
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dny
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7樓2010-08-09 17:31:45
stevenabing
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不用那玩意，你用PLATON計算后就有pai-pai堆積的相關數(shù)據(jù)，然后在CIF文件中直接加入這個額外的模塊即行，具體似乎在他們的網(wǎng)站上有的 Extra tables in CIF •hydrogen-bonding tables •extra tables •contacts tables Hydrogen-bonding tables The following data names should be used. loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_D _geom_hbond_site_symmetry_H _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag. Extra tables The following data names should be used. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_extra_tableA_col_1' '_geom_extra_tableA_col_2' '_geom_extra_tableA_col_3' '_geom_extra_tableA_col_4' '_geom_extra_tableA_col_5' '_geom_extra_tableA_col_6' '_geom_extra_tableA_col_7' '_geom_extra_tableA_col_8' '_geom_extra_tableA_col_9' '_geom_extra_tableA_col_10' '_geom_extra_tableA_col_11' '_geom_extra_tableA_col_12' '_geom_extra_tableA_col_13' '_geom_extra_tableA_col_14' # up to 14 columns '_geom_extra_table_head_A' # for table heading '_geom_table_headnote_A' # for table headnote if needed '_geom_table_footnote_A' # for table fn if needed # and for a second extra table in the same datablock: '_geom_extra_tableB_col_1' '_geom_extra_tableB_col_2' '_geom_extra_tableB_col_3' '_geom_extra_tableB_col_4' '_geom_extra_tableB_col_5' '_geom_extra_tableB_col_6' '_geom_extra_tableB_col_7' '_geom_extra_tableB_col_8' '_geom_extra_tableB_col_9' '_geom_extra_tableB_col_10' # up to ten columns '_geom_extra_table_head_B' # for table heading '_geom_table_headnote_B' # for table headnote if needed '_geom_table_footnote_B' # for table fn if needed For example, adding the following lines to the CIF generates an exta table (Table 1), which is shown below as it would appear in the html version of the published paper. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_extra_tableA_col_1' '_geom_extra_tableA_col_2' '_geom_extra_tableA_col_3' '_geom_extra_table_head_A' '_geom_table_footnote_A' loop_ _geom_extra_tableA_col_1 _geom_extra_tableA_col_2 _geom_extra_tableA_col_3 L 'Pd---P' 'Pd---Br' 'PTA^a^' 2.320(1) 2.427(1) 'PPh~2~(o-Cl-Ph)^b^' 2.350(2) 2.423(1) 'DDEP^c^' 2.325(3) 2.412(1) 'DPA^d^' 2.322(2) 2.447(1) 'ppq^e^' 2.318(1) 2.435(1) 'DMPP^f^' 2.319(2) 2.433(1) ? 2.313(2) 2.435(1) 'PPh~3~^g^' 2.34(4) 2.42(4) 'P(o-Tol)~3~^h^' 2.370(1) 2.445(2) _geom_extra_table_head_A ; Comparative geometrical parameters (\%A) for selected trans-[PdBr~2~(L)~2~] (L = tertiary phosphine ligand) complexes ; _geom_table_footnote_A ; Notes: (a) this work; (b) Coalter et al. (2000); (c) Ganguly et al. (1992) [DDEP is 2-(diphenylphosphino)ethanephosphonate]; (d) Podlahova et al. (1979) (DPA is diphenylphosphinoacetic acid); (e) Sembiring et al. (1995) (ppq is p-quinonyldiphenylphosphine); (f) Wilson et al. (1996) (DMPP is 1-phenyl-3,4-dimethylphosphole); (g) Stark et al. (1997); (h) Vicente et al. (1997). ; Table 1 Comparative geometrical parameters (Å  for selected trans-[PdBr2(L)2] (L = tertiary phosphine ligand) complexes L Pd-P Pd-Br PTAa 2.320 (1) 2.427 (1) PPh2(o-Cl-Ph)b 2.350 (2) 2.423 (1) DDEPc 2.325 (3) 2.412 (1) DPAd 2.322 (2) 2.447 (1) ppqe 2.318 (1) 2.435 (1) DMPPf 2.319 (2) 2.433 (1) 2.313 (2) 2.435 (1) PPh3g 2.34 (4) 2.42 (4) P(o-Tol)3h 2.370 (1) 2.445 (2) Notes: (a) this work; (b) Coalter et al. (2000); (c) Ganguly et al. (1992) [DDEP is 2-(diphenylphosphino)ethanephosphonate]; (d) Podlahova et al. (1979) (DPA is diphenylphosphinoacetic acid); (e) Sembiring et al. (1995) (ppq is p-quinonyldiphenylphosphine); (f) Wilson et al. (1996) (DMPP is 1-phenyl-3,4-dimethylphosphole); (g) Stark & Whitmore (1997); (h) Vicente et al. (1997). Contacts tables The following data names should be used. loop_ _publ_manuscript_incl_extra_item '_geom_contact_atom_site_label_1' '_geom_contact_atom_site_label_2' '_geom_contact_distance' '_geom_contact_site_symmetry_1' '_geom_contact_site_symmetry_2' '_geom_contact_publ_flag' loop_ _geom_contact_atom_site_label_1 _geom_contact_atom_site_label_2 _geom_contact_distance _geom_contact_site_symmetry_1 _geom_contact_site_symmetry_2 _geom_contact_publ_flag |
8樓2010-08-09 17:47:30
stevenabing
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