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lifei_dut金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】氨基酸序列三維結(jié)構(gòu)的獲得 已有2人參與
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請教大家，我通過實驗得到下列氨基酸序列，能否通過軟件將他的三維結(jié)構(gòu)顯示出來？ 如果能，應該如何做呢？ 急盼大家?guī)兔Γ指兄x。 MPTYKYSYFDVRGRGELVRYVFHAAGRDFEDDRVAREDWPSRKESTPFGQMPVLDVDGKKLAQSGAIARYAAREFDLAGKDSWEQALVDQYMGLVEDMFTEIVKVFFEKDEEKKKELQKNLAEVVFPKFCGLFEKALDQNGGKFFVGNSLTLADLAVLNAFDTPLHQHATLLDSFPKLKAHRERVMATPKLSEYIKNRKVTDI |
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回復
★ ★
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-08-13 15:20:43
lifei_dut(金幣+2):謝謝你的幫助，我試試看。 2010-08-13 17:18:28
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-08-13 15:20:43
lifei_dut(金幣+2):謝謝你的幫助，我試試看。 2010-08-13 17:18:28
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http://swissmodel.expasy.org/ 申請個賬號，用郵箱注冊，然后登陸，選擇automated mode,粘貼你的序列，submit，大約20分鐘你的郵箱就會收到信息，就可以查看已經(jīng)模擬好的結(jié)構(gòu) [ Last edited by skee2008 on 2010-8-13 at 12:22 ] |
2樓2010-08-13 12:21:55
ASP2009
銀蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
可以
★ ★ ★ ★
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-08-13 15:20:52
lifei_dut(金幣+5):謝謝你的解釋，要是能再詳細一下說明就更好了。 2010-08-13 17:17:53
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-08-13 15:20:52
lifei_dut(金幣+5):謝謝你的解釋，要是能再詳細一下說明就更好了。 2010-08-13 17:17:53
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直接提交到 Swiss-model自動建模的話 可能不是十分準確，最好自己手工一步步做。 既然是新測的序列，估計PDB里面沒有對應的結(jié)構(gòu)�？梢杂猛茨＝ㄟM行三級結(jié)構(gòu)預測。 首先把你的蛋白質(zhì)序列進行blast，找到相似的結(jié)構(gòu)作為模板，序列相似性大于30%的話就可以進行，模板可以不止一個，然后進行序列比對，比對可能需要調(diào)整。spdbv上就有一個同源模建的專題，按照上面做一遍就會了。 |
3樓2010-08-13 15:15:56
4樓2010-08-18 08:38:29
藍洋飄雪
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5樓2015-07-13 15:29:23
6樓2015-07-16 09:58:54
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