 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1016 | 回復(fù): 1 | |||
patent至尊木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
|
[交流]
【求助】怎樣限定兩個(gè)原子之間的距離
|
|
我用gromacs跑受體－配體復(fù)合物的動(dòng)力學(xué)，要限定受體的N原子和配體的O原子之間的距離在0.3nm左右，以便形成氫鍵，但不知怎樣限定這兩個(gè)原子之間的距離，請(qǐng)高手指教，謝謝�。�！ 有網(wǎng)友說(shuō)在top文件中加入： [distance_restraints] ; i j type index type' low up1 up2 fac 33 698 1 0 1 0.3 0.3 0.3 1 我試過(guò)，MD時(shí)報(bào)錯(cuò)，說(shuō)限定的兩個(gè)原子不在同一個(gè)分子內(nèi)。 請(qǐng)問(wèn)還有其它的方法嗎，萬(wàn)分感謝！�。� |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
070300化學(xué)354求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
286分調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
287求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿鄭大材料工程290求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料科學(xué)與工程調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
化學(xué)308分調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
300求調(diào)劑，材料科學(xué)英一數(shù)二
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
085701求調(diào)劑初試286分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 兩個(gè)原子的局域態(tài)密度在費(fèi)米處重疊
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 兩個(gè)原子靠近成鍵的過(guò)程中，系統(tǒng)總能量會(huì)不會(huì)發(fā)生變化？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 三個(gè)原子之間的勢(shì)能面掃描怎么做？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 兩個(gè)表面之間作用能或原子吸附能的計(jì)算疑惑
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何限制原子半徑？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 高斯中兩個(gè)原子的位置重合
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】怎么算出兩個(gè)環(huán)之間的質(zhì)心（面心）間的距離？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】計(jì)算兩原子間距離
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】怎樣固定原子和距離
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】如何在diamond 中看出兩個(gè)原子間的距離？
已經(jīng)有3人回復(fù)
紅楓葉688
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 4790.5
- 散金: 3
- 紅花: 1
- 帖子: 227
- 在線: 59小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 469001
- 注冊(cè): 2007-11-28
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2010-08-20 21:36:28
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 patent 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[基金申請(qǐng)] 面上5B能上會(huì)嗎？ +7 | redcom 2026-03-29 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +5 | AZMK 2026-03-29 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分 +6 | Shern—- 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +10 | 誰(shuí)不是少年 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | dfffsar 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | QiMing7 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +4 | 蝶舞輕繞 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 爭(zhēng)取九點(diǎn)睡 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料277求調(diào)劑 +7 | min3 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +12 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +6 | HanBeiNingZC 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑 +4 | 愛(ài)吃番茄的旭 2026-03-24 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑推薦 +5 | 清酒714 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院-光纖傳感課題組招生-中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、深圳理工大學(xué)聯(lián)培 +5 | YangTyu1 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿河工大 081700 276求調(diào)劑 +4 | 地球繞著太陽(yáng)轉(zhuǎn) 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿北化315 求調(diào)劑 +3 | akrrain 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[有機(jī)交流]
 有機(jī)合成求助
 20+3
|
FENGSHUJEI 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南航材料專317分求調(diào)劑 +5 | 炸呀炸呀炸薯?xiàng)l 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿山東大學(xué)藥學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +3 | 開(kāi)開(kāi)心心沒(méi)煩惱 2026-03-23 | 4/200 |
|