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【求助/交流】引物設(shè)計(jì)原則說3‘端避開密碼子第3位，何解？ 已有9人參與
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| 不明白這密碼子第3位是什么意思？是不是起始密碼為ATG，引物3’ 端就不能是G呢？新手上路，多多指教��！ |
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6樓2010-08-18 15:01:05
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10樓2010-08-19 15:39:02
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Crick對(duì)于tRNA能識(shí)別幾種密碼子的現(xiàn)象，提出堿基配對(duì)的“擺動(dòng)學(xué)說”： 認(rèn)為除A-U、G-C配對(duì)外，還有非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì)，I-A、I-C、I-U，并強(qiáng)調(diào)密碼子的5’端第1、2個(gè)堿基嚴(yán)格遵循標(biāo)準(zhǔn)配對(duì)，而第3個(gè)堿基可以非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì)，具有一定程度的擺動(dòng)靈活性。 |
2樓2010-08-18 14:24:23
3樓2010-08-18 14:28:41
feiye2214
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4樓2010-08-18 14:42:25
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5樓2010-08-18 14:46:45
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7樓2010-08-19 14:02:05
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看天(金幣+2):鼓勵(lì)交流 2010-08-19 15:58:08
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5樓搞錯(cuò)了，不是引物的第一個(gè)堿基。其他人的意見可能正確。 以下來自百度：“擴(kuò)增編碼區(qū)域，引物3′端不要終止于密碼子的第3位，因密碼子的第3位易發(fā)生簡(jiǎn)并，會(huì)影響擴(kuò)增的特異性與效率�！� 但我不太明白了： 1，我們PCR擴(kuò)增DNA序列，用的是dNTPs，也就是ATGC的混合液，這不存在所謂tRNA的非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì)，因?yàn)椴皇荝NA轉(zhuǎn)錄，而是DNA復(fù)制。 2，tRNA上才存在所謂擺動(dòng)原則吧，這跟PCR中的DNA復(fù)制有關(guān)系嗎？ 所以，對(duì)于我們體外擴(kuò)增DNA，“引物3‘端要避開密碼子第三位”這個(gè)說法，我暫時(shí)不能贊同！ 求指點(diǎn)。 |
8樓2010-08-19 14:27:53
lihaoexe
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9樓2010-08-19 14:41:07
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