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[交流]
【求助/交流】關(guān)于微陣列實(shí)驗(yàn) 已有6人參與
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有人講mircor-arry 測(cè)不出單個(gè)基因的表達(dá)量，這句話怎么理解？每個(gè)探針返回的值不是 每個(gè)基因的表達(dá)量嗎？ 偶是菜鳥，請(qǐng)指教 |
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2樓2010-08-23 12:55:02
lwiaanngg
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3樓2010-08-23 13:05:47
4樓2010-08-24 11:15:19
lwiaanngg
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
silicare(金幣+1):謝謝專家 2010-08-25 08:48:36
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silicare(金幣+1):謝謝專家 2010-08-25 08:48:36
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具體到你所說的數(shù)據(jù)，每個(gè)人的表達(dá)思路不一樣，你需要看paper上給出的到底是相對(duì)量還是絕對(duì)量。相對(duì)量應(yīng)該較多些，個(gè)人不太相信絕對(duì)值。 多少探針對(duì)應(yīng)表達(dá)量，要看你的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。 Microarray 還是比較貴的，實(shí)驗(yàn)前最好做充分的準(zhǔn)備了 |
5樓2010-08-24 13:26:54
sqhnsd
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silicare(金幣+2):繼續(xù)~ 2010-08-25 08:39:46
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這個(gè)意思很明確，所謂單個(gè)基因表達(dá)量，就是這個(gè)基因的mRNA有多少個(gè)copy。芯片數(shù)據(jù)只能相對(duì)比較表達(dá)程度的高低，但是確切的copy number是不知道的。比如，一張芯片雜交sample A, another chip for sample B. 該基因芯片中包括100個(gè)基因，你的實(shí)驗(yàn)只能表明，這100基因中，gen1的表達(dá)量在A中高還是B中高，但是表達(dá)量有多大，你是不知道的。測(cè)序可以解決這個(gè)問題，因?yàn)樗梢杂?jì)算copy number. |
6樓2010-08-24 15:17:25
wallace974
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7樓2010-08-24 15:31:15
sqhnsd
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8樓2010-08-24 15:55:46
wallace974
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9樓2010-08-24 16:05:50
dayong3492
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10樓2010-08-24 16:20:21
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