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hc1027木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請問大家分析抗性基因(或差異表達基因等相關的)的方法有哪些?比如DNA微陣列。。。
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想了解下分析或篩選抗性基因(或差異表達基因等相關的)的方法有哪些?以及優(yōu)缺點?謝謝大家! 請大家針對自己所知道的談談吧,做過的話談談難易程度及分享下實驗心得感想吧。 我知道的有: DNA微陣列、cDNA-AFLP、抑制消減雜交法SSH等 請問大家目前什么方法比較公認的呢? |
生物信息學軟件應用 | 核酸生物學實驗經(jīng)驗 |
木蟲 (正式寫手)
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首先感謝您的熱心回復。 因為接觸這方面比較少,關于真菌抗性基因的篩選我目前看到的文獻大多是關于cDNA-AFLP、DNA 微陣列的、其他的了解不多。 我的知識也是主要來自于文獻的閱讀,看過好些篇用上述方法分析菌的抗性基因的,所以就按照他們的方法照著做。而對你上面講的雜交、顯隱關系論文沒見過(至少看出你很專業(yè)了,我專業(yè)不是學這個的,請見諒),但是覺得你的分析很有道理。能否提供幾篇關于你說的方法的論文呢?最好是權威的、英文的。 此外弱弱的問下: 1、對于抗性菌和非抗性菌,cDNA-AFLP獲得的差異表達基因(TDF),也只能確定TDF是脅迫下的結果(可能很多個),也不能確定具體是哪個基因決定這種抗性,對吧? 2、然后應該怎么做才能確定是哪個基因決定抗性呢?基因敲除?還是有其他的? 圖位克隆能解決這個問題嗎?難度以及工作量如何? O(∩_∩)O謝謝 祝新年愉快,闔家幸福! |
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