 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2991 | 回復(fù): 3 | |||
微風(fēng)breeze鐵蟲(chóng) (初入文壇)
|
[交流]
【求助】NVT弛豫問(wèn)題 已有2人參與
|
|
現(xiàn)在在NVT弛豫這塊遇到了問(wèn)題： 1、NVT弛豫之前需不需要minimize 2、用NVT弛豫是不是就是fix NVT然后run一段時(shí)間，直到勢(shì)能和總能在某一個(gè)值上下波動(dòng)，即平衡？ 3、給定初始速度應(yīng)該在哪里給定，minimize之前，還是minimize與fix NVT之間，還是別的?還有關(guān)于velocity命令的迷惑，velocity create XX seed（自己隨便寫還是用別的方法產(chǎn)生）temp temp_compute（這個(gè)計(jì)算的溫度和前面的XX問(wèn)題有什么區(qū)別，它對(duì)于velocity這個(gè)命令到底有什么作用） 4、為什么我fix NVT之后，跑了很長(zhǎng)時(shí)間還是無(wú)法達(dá)到我指定的溫度，比如 fix NVT 293.0 293.0 5 drag 0.2 run 120000之后，得到的圖像是這樣的，  好像沒(méi)達(dá)到平衡，不知道是哪出錯(cuò)了，溫度也不能達(dá)到293K 請(qǐng)大家?guī)兔鉀Q下，謝謝！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
0703化學(xué)336分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
[復(fù)試調(diào)劑]西南科技大學(xué)國(guó)防/材料導(dǎo)師推薦
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
化學(xué)工程321分求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自動(dòng)化所實(shí)習(xí)
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料專碩326求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
東南大學(xué)364求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
國(guó)自科面上基金字體
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
藥學(xué)383 求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- vasp計(jì)算界面結(jié)構(gòu)時(shí)原子弛豫的問(wèn)題
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 兩個(gè)原子靠近成鍵的過(guò)程中，系統(tǒng)總能量會(huì)不會(huì)發(fā)生變化？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- NPT系綜的平衡問(wèn)題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 為什么做表面弛豫時(shí)，真空層位置不同會(huì)對(duì)結(jié)果有顯著影響？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【討論】高溫高壓的體系需要注意的環(huán)節(jié)
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 【討論】lammps中怎樣檢驗(yàn)?zāi)M系統(tǒng)在NVT系綜下弛豫是否達(dá)到平衡？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】弱問(wèn)lammps弛豫問(wèn)題
已經(jīng)有3人回復(fù)
微風(fēng)breeze
鐵蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 46.5
- 帖子: 4
- 在線: 3.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1073752
- 注冊(cè): 2010-08-12
2樓2010-08-30 15:17:27
qphll
金蟲(chóng) (正式寫手)
- 模擬EPI: 10
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2708.7
- 散金: 2294
- 紅花: 8
- 帖子: 554
- 在線: 227.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 89654
- 注冊(cè): 2005-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 碳素材料與超硬材料
3樓2010-12-03 11:16:09
qphll
金蟲(chóng) (正式寫手)
- 模擬EPI: 10
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2708.7
- 散金: 2294
- 紅花: 8
- 帖子: 554
- 在線: 227.1小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 89654
- 注冊(cè): 2005-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 碳素材料與超硬材料
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+10):thank you 2010-12-03 15:27:11
小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+10):thank you 2010-12-03 15:27:11
|
1、NVT弛豫之前需不需要minimize 當(dāng)然需要!! minimization的主要作用是消除原子間的 overlap, 不做其他的事情. 2、用NVT弛豫是不是就是fix NVT然后run一段時(shí)間，直到勢(shì)能和總能在某一個(gè)值上下波動(dòng)，即平衡？ 對(duì)的. 只需要看總能量就可以了, 因?yàn)镹和T是定值, 那么kinetic energy是定值, 所以勢(shì)能和總能是一個(gè)概念了. 3、給定初始速度應(yīng)該在哪里給定，minimize之前，還是minimize與fix NVT之間，還是別的?還有關(guān)于velocity命令的迷惑，velocity create XX seed（自己隨便寫還是用別的方法產(chǎn)生）temp temp_compute（這個(gè)計(jì)算的溫度和前面的XX問(wèn)題有什么區(qū)別，它對(duì)于velocity這個(gè)命令到底有什么作用） 參見(jiàn) 1. 回答. minimization 不需要你初速度的信息, 所以放哪里都無(wú)所謂, 你可以嘗試的. 便于理解的話, 你就這樣放在minize后面好了. velocity的問(wèn)題, 手冊(cè)講得很清楚了, 再去讀一下吧. 4、為什么我fix NVT之后，跑了很長(zhǎng)時(shí)間還是無(wú)法達(dá)到我指定的溫度，比如 fix NVT 293.0 293.0 5 drag 0.2 顯然你需要找到一個(gè)優(yōu)化值, 而不是就用0.2, 參見(jiàn)這個(gè)帖子: http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2435901&fpage=1 雖然fix NVT 用的是Nose-Hoover 和 berendsen thermostat 實(shí)現(xiàn)方法上有些不同, 但是基本的道理還是一樣的. 好了, 注意了這些以后, 等你的T穩(wěn)定了, 給大家上新圖. |
4樓2010-12-03 11:26:48
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 微風(fēng)breeze 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +6 | 邱gl 2026-03-11 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +9 | 大米飯！ 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
[考研] 藥學(xué)383 求調(diào)劑 +3 | 藥學(xué)chy 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +3 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語(yǔ)六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求老師收留調(diào)劑 +4 | jiang姜66 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +5 | 步川酷紫123 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +3 | 5201314Lsy！ 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿湖師大化學(xué)289求調(diào)劑 +6 | XMCMM3.14159 2026-03-10 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +5 | 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料工程調(diào)劑 +9 | 咪咪空空 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] ［0860］321分求調(diào)劑，ab區(qū)皆可 +4 | 寶貴熱 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +9 | 小羊小羊_ 2026-03-11 | 10/500 |
|
|
|
[碩博家園] 085600 260分求調(diào)劑 +3 | 天空還下雨么 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 【0856】化學(xué)工程（085602）313 分，本科學(xué)科評(píng)估A類院校化學(xué)工程與工藝，誠(chéng)求調(diào)劑 +7 | 小劉快快上岸 2026-03-11 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 270求調(diào)劑 085600材料與化工專碩 +3 | YXCT 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 讀博申請(qǐng) +5 | 感dd 2026-03-10 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 大連大學(xué)化學(xué)專業(yè)研究生調(diào)劑 +3 | 琪久. 2026-03-10 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +3 | 莫xiao 2026-03-10 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +5 | 呵唔哦豁 2026-03-10 | 5/250 |
|