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[交流] 【求助】怎么樣才使R值減小點呢？求助已有5人參與

我最近收錄了一個晶體，空間群已經確定
但是R值仍然很高，
R1 =  0.3393 for 102 Fo > 4sig(Fo)  and  0.5081 for all 324 data
wR2 =  0.5168,  GooF = S = 1.899,  Restrained GooF = 1.899  for all data
我嘗試著Omit了一些壞點，但是R1和R1(all data)相差太大，
如下:
Final R indices [I>2sigma(I)]    R1 = 0.0580, wR2 = 0.1008

   R indices (all data)             R1 = 0.3322, wR2 = 0.1851
Goodness-of-fit on F^2          0.885
用什么辦法使R值減小啊？
在線等，萬分感激！

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1樓 2010-08-27 22:46:23

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請正確指認原子，并在ins文件中加入各向異性修正指令！

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2樓2010-08-28 08:29:33

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帝夫(金幣+1):感謝回帖交流！ 2010-08-29 23:04:03

1. 請確定 space group, crystal system 是否正確
2. 確定分子內所有包含架構是否已完全解析完畢,也包含是否還有溶劑分子

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3樓2010-08-28 09:18:54

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不斷的確認原子，在res文件里面更改權重并保存到ins文件中

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4樓2010-08-28 10:20:49

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引用回帖:

Originally posted by Nocturne at 2010-08-27 22:46:23:
我最近收錄了一個晶體，空間群已經確定
但是R值仍然很高，
R1 = 0.3393 for 102 Fo > 4sig(Fo) and 0.5081 for all 324 data
wR2 = 0.5168, GooF = S = 1.899, Restrained GooF = 1.899 ...

我的化合物很簡單就是1,2-環(huán)己烷二胺，C6H14N2
空間群應該是對的，謝謝回復

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5樓2010-08-29 19:32:40

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引用回帖:

Originally posted by cfocus20 at 2010-08-28 09:18:54:
1. 請確定 space group, crystal system 是否正確
2. 確定分子內所有包含架構是否已完全解析完畢,也包含是否還有溶劑分子

你的意思是在.res文件中更改第二個WGHT 數值，還是把此數值copy到ins文件中？
多謝指導

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6樓2010-08-29 19:34:38

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引用回帖:

Originally posted by 帝夫 at 2010-08-28 08:29:33:
請正確指認原子，并在ins文件中加入各向異性修正指令！

謝謝斑竹的金幣，呵呵
我以前收錄了一個晶體，數據比這個好，空間確定是P21212.
這個晶體的參數和上一個差不多，只是稍微收縮了，我覺得空間群沒錯，另外我的peak最大為0.38，我覺得可能是數據差的原因。

此外，在lst文件中中的Most disagreebale reflections
發(fā)現一些點，在.hkl文件中找不到是什么原因啊？
謝謝！

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7樓2010-08-29 19:44:42

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帝夫(金幣+1):感謝回帖交流！ 2010-08-29 23:04:03

引用回帖:

Originally posted by Nocturne at 2010-08-29 19:34:38:

你的意思是在.res文件中更改第二個WGHT 數值，還是把此數值copy到ins文件中？
多謝指導

將lst檔內的wght 後面這個值copy 至ins檔再進行精修!!
Recommended weighting scheme: WGHT 0.0967 0.0000

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8樓2010-08-29 22:29:58

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引用回帖:

Originally posted by Nocturne at 2010-08-29 19:44:42:

謝謝斑竹的金幣，呵呵
我以前收錄了一個晶體，數據比這個好，空間確定是P21212.
這個晶體的參數和上一個差不多，只是稍微收縮了，我覺得空間群沒錯，另外我的peak最大為0.38，我覺得可能是數據差的原因。

...

你的最大的peak才0.38，是對所有的原子峰說的嗎？這不太可能吧！
找到lst里的壞點直接在ins里omit它就行了啊，為啥還要跑到hkl里找他呀？

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9樓2010-08-29 23:16:14

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帝夫(金幣+1):感謝回帖交流！ 2010-08-31 01:01:07

引用回帖:

Originally posted by 帝夫 at 2010-08-29 23:16:14:

你的最大的peak才0.38，是對所有的原子峰說的嗎？這不太可能吧！
找到lst里的壞點直接在ins里omit它就行了啊，為啥還要跑到hkl里找他呀？

我一開始也是在這樣做的，但是最后兩個R1值相差太大，總感覺不合適
Qpeak
Fourier peaks appended to .res file

            x    y    z    sof    U    Peak Distances to nearest atoms (including symmetry equivalents)

Q1 1  -0.8484 -1.3246 -0.6695 1.00000  0.05 0.36 1.67 H1A  1.77 H2A  2.03 H2B  2.16 H1B
Q2 1  -0.3400 -1.1811 -1.0152 1.00000  0.05 0.23 1.01 H3A  1.78 H2A  1.92 C3  2.03 H2B
Q3 1  -0.6583 -1.6572 -0.8250 1.00000  0.05 0.22 1.12 H2A  1.68 H3A  1.69 C2  1.72 H1D
Q4 1  -0.6471 -1.4083 -1.1603 1.00000  0.05 0.19 0.75 H3B  1.65 C3  1.91 H1B  1.99 H2B
Q5 1  -0.4099 -1.1159 -1.1545 1.00000  0.05 0.18 1.43 H3A  1.70 H2A  2.10 H3B  2.11 C3
Q6 1  -0.7579 -1.0704 -0.6967 1.00000  0.05 0.17 1.26 H2B  1.88 H1A  1.96 H1B  1.98 C2
Q7 1  -0.6345 -1.2483 -0.9141 1.00000  0.05 0.17 0.84 C2  0.91 H2B  1.13 C3  1.40 H3B
Q8 1  -0.4160 -1.2073 -0.6663 1.00000  0.05 0.17 0.37 H1D  1.32 C1  2.02 H1A  2.23 C2
Q9 1  -0.8223 -1.5985 -0.7546 1.00000  0.05 0.17 1.27 H2A  1.85 H1B  1.85 H3B  2.18 H1A
Q10 1  -0.8413 -1.3838 -0.4550 1.00000  0.05 0.16 1.14 H1A  1.37 H1D  1.85 N1  2.16 H1A
Q11 1  -0.3720 -1.3816 -0.6587 1.00000  0.05 0.16 1.00 H1D  1.41 C1  1.51 C1  1.66 H2A
Q12 1  -0.4800 -1.1311 -0.4568 1.00000  0.05 0.16 1.42 H1B  1.58 H1D  1.60 N1  1.96 C1
Q13 1  -0.5692 -1.0913 -0.7748 1.00000  0.05 0.15 1.03 H2B  1.39 C2  1.57 H1D  1.73 C1
Q14 1  -0.5000 -1.0000 -0.6404 0.50000  0.05 0.14 1.30 H1D  1.91 C1  2.18 H2B  2.26 N1
Q15 1  -0.7269 -1.5897 -1.0058 1.00000  0.05 0.14 1.55 H2A  1.60 H2B  1.73 H3B  1.79 H3A
Q16 1  -0.6138 -1.1218 -0.4435 1.00000  0.05 0.13 1.10 N1  1.19 H1B  1.33 H1A  2.10 C1
Q17 1  -0.7189 -1.4120 -0.7960 1.00000  0.05 0.13 0.32 H2A  0.89 C2  1.35 H2B  1.90 C1
Q18 1  -0.5999 -1.1949 -0.4459 1.00000  0.05 0.13 0.78 N1  0.83 H1B  1.22 H1A  1.84 C1
Q19 1  -0.6156 -1.2303 -1.2334 1.00000  0.05 0.12 1.27 H3B  1.36 H1B  2.04 N1  2.05 H2A
Q20 1  -0.3308 -1.3756 -1.0181 1.00000  0.05 0.12 1.30 H3A  1.63 H3B  1.76 H2A  1.76 C3
____________________________________________________________
感覺Q1有點大，我看了下
是獨立的原子，我覺得Q1可能性不大

[ Last edited by Nocturne on 2010-8-30 at 16:36 ]

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10樓2010-08-30 16:35:25

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