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yuzhouren至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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[交流]
【求助】請(qǐng)問(wèn)分子最小能量結(jié)果怎么不一致？ 已有2人參與
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這個(gè)問(wèn)題可能比較弱弱~我從沒(méi)有接觸過(guò)~ 請(qǐng)問(wèn)各位大蝦我用MM2,GAMESS,MMFF94計(jì)算某一分子的能量怎么不一樣呢，謝謝！ 有兩個(gè)審稿人說(shuō)了要用理論計(jì)算什么的，我不懂，請(qǐng)看 reviewer 1:........In figure 3, where do the relative energies come from? There is no justification or explanation...........Even a quick RHF/3-21G calculation would go a long way here. reviewer 2:The intuitive ideas used by the authors in the formulation of the proposed mechanism might be correct, but these should have been verified through quantum-chemical calculations at an appropriate level of theory, for example, DFT. 還請(qǐng)各位大蝦給予指點(diǎn)，謝謝！ |
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yuzhouren
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2樓2010-09-06 11:19:41
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3樓2010-09-06 13:12:14
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★ ★ ★
mingdong(金幣+3):感謝交流！ 2010-09-06 16:24:47
yuzhouren(金幣+3):謝謝指教，我是打算再加一個(gè)進(jìn)去的 2010-09-07 00:22:27
mingdong(金幣+3):感謝交流！ 2010-09-06 16:24:47
yuzhouren(金幣+3):謝謝指教，我是打算再加一個(gè)進(jìn)去的 2010-09-07 00:22:27
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餓 補(bǔ)充一下 你用的方法不同計(jì)算出來(lái)的能量肯定不一樣，因?yàn)椴扇〉哪Ｐ停圃矶疾煌�。建議采用比較精確的方法，也就是調(diào)用大基組。 RHF/3-21G 就是采用HF( hartree fock)方法調(diào)用3-21G基組進(jìn)行計(jì)算。很多計(jì)算軟件都可以完成這個(gè)計(jì)算。你只要在文章中注明你是如何得到的應(yīng)該就可以了。 |
4樓2010-09-06 15:52:51
yuzhouren
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5樓2010-09-07 00:27:00
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6樓2010-09-07 08:50:06
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7樓2010-09-07 12:30:36
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★
dongdong3881(金幣+1):多謝參與 2010-09-08 16:33:59
yuzhouren(金幣+1):我是在計(jì)算多個(gè)反應(yīng)的勢(shì)能，看看反應(yīng)是朝著哪個(gè)方向進(jìn)行，如果哪個(gè)勢(shì)能小，就從哪個(gè)方向進(jìn)行，我是比較這個(gè)的，但是，正如你所說(shuō)的那樣，前后兩個(gè)物質(zhì)的最小能量我可以算算，可是過(guò)渡態(tài)那個(gè)不知道怎么算，不然就可以直接算出來(lái)活化能了，謝謝關(guān)注，關(guān)于金幣我可以再次補(bǔ)加！ 2010-09-08 16:46:24
dongdong3881(金幣+1):多謝參與 2010-09-08 16:33:59
yuzhouren(金幣+1):我是在計(jì)算多個(gè)反應(yīng)的勢(shì)能，看看反應(yīng)是朝著哪個(gè)方向進(jìn)行，如果哪個(gè)勢(shì)能小，就從哪個(gè)方向進(jìn)行，我是比較這個(gè)的，但是，正如你所說(shuō)的那樣，前后兩個(gè)物質(zhì)的最小能量我可以算算，可是過(guò)渡態(tài)那個(gè)不知道怎么算，不然就可以直接算出來(lái)活化能了，謝謝關(guān)注，關(guān)于金幣我可以再次補(bǔ)加！ 2010-09-08 16:46:24
| 很重要的一點(diǎn) 應(yīng)該比較的是relative energy 貌似樓主一直是拿直接計(jì)算得到的數(shù)值在說(shuō) |
8樓2010-09-08 15:21:09
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9樓2010-09-08 16:50:43
yuzhouren
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10樓2010-09-08 21:26:16
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