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[交流]
【討論】大家對未來GPU在monte carlo中的應用持有什么樣的態(tài)度(CUDA)？ 已有6人參與
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| 現(xiàn)在很多蒙特卡羅的開源代碼不能并行，這是一個缺憾，導致很多時候，運行效率很低。 |
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yahoohoo
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★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+5):謝謝 在點子上 2010-09-11 20:51:51
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+5):謝謝 在點子上 2010-09-11 20:51:51
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首先提醒一點，做科研千萬不要想當然。 MD的并行和MC的并行完全是兩碼事。在MD中，每一步我們都需要更新力和位移。由于力的計算最為耗時，因此我們可以采用不同的手段，譬如 MPI或OpenMP 進行并行，將計算力的任務分配到多個CPU或核上。而MC的并行卻不像MD這么直觀。絕大多數(shù)的MC算法都是局域的，即local move，意思是MC運動只涉及體系中的部分原子位置的變化。因此MC最為有效的做法，也是大家一貫采用的做法，就是在MC運動前后計算涉及到的那一部分原子的能量變化。正因為MC運動的這種局域性，利用并行計算能量并不能有效地加速MC模擬。而且這種并行計算能量的做法也并不是真正意義上的Parallel MC。真正的Parallel MC是指我們可以平行選取體系中的幾個局部，而這幾個局部是彼此對立的，那么對每個部分就可以單獨施行MC運動，而不至于相互影響。簡單而言，Parallel MC就是可以同時改變體系的多個局部構(gòu)象。很顯然，這與Parallel MD完全不是一個概念。 [ Last edited by yahoohoo on 2010-9-11 at 19:37 ] |
6樓2010-09-11 19:35:24
2樓2010-09-11 10:57:31
材料類初學者可以看的書
★ ★
zh1987hs(金幣+2):謝謝您的介紹 2010-09-11 11:31:12
zh1987hs(金幣+2):謝謝您的介紹 2010-09-11 11:31:12
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材料類初學者可以看的書除了《概率論》《蒙特卡羅方法引論》《蒙特卡羅方法》等MC基礎(chǔ)書外，做材料（主要包括高分子材料，固體材料，薄膜材料）的同行們可以看一下《計算材料學》(德)D.羅伯(Dierk Raabe)編著，項金鐘,吳興惠譯；《計算材料科學》陳舜麟編著；《分子模擬》(荷)Frenkel，Smit著，汪文川等譯； 這些書既與MC方法有關(guān)，又與你所研究的方向有關(guān)，而且難度并不是特別大。除此之外就是要學習編程語言，現(xiàn)在主要用的是fortran,c,VB,這三種都有現(xiàn)成的源程序可以參考，尤其是fortran，專門作科學計算用，臺灣人彭國倫寫的《Fortran 95》就很不錯，網(wǎng)上也有電子版，除此之外，還有徐士良的《Fortran算法程序集》。c語言我不太會用沒有發(fā)言權(quán)。VB的好處就是可視化，操作也很方便，也有大量的應用�？傊�，材料是一個交叉學科，比較難，所以大家都不能急功近利，要耐得住寂寞，終有所成。上面所列舉的書，本論壇應該都有電子版，大家可以查一查。以上是我自己的一家之言，不足之處請大家指正。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
neoxie3樓2010-09-11 11:26:06
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