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[交流]
【討論】大家對(duì)未來GPU在monte carlo中的應(yīng)用持有什么樣的態(tài)度(CUDA)？ 已有6人參與
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| 現(xiàn)在很多蒙特卡羅的開源代碼不能并行，這是一個(gè)缺憾，導(dǎo)致很多時(shí)候，運(yùn)行效率很低。 |
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yahoohoo
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+5):謝謝 在點(diǎn)子上 2010-09-11 20:51:51
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
lei0736(金幣+5):謝謝 在點(diǎn)子上 2010-09-11 20:51:51
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首先提醒一點(diǎn)，做科研千萬不要想當(dāng)然。 MD的并行和MC的并行完全是兩碼事。在MD中，每一步我們都需要更新力和位移。由于力的計(jì)算最為耗時(shí)，因此我們可以采用不同的手段，譬如 MPI或OpenMP 進(jìn)行并行，將計(jì)算力的任務(wù)分配到多個(gè)CPU或核上。而MC的并行卻不像MD這么直觀。絕大多數(shù)的MC算法都是局域的，即local move，意思是MC運(yùn)動(dòng)只涉及體系中的部分原子位置的變化。因此MC最為有效的做法，也是大家一貫采用的做法，就是在MC運(yùn)動(dòng)前后計(jì)算涉及到的那一部分原子的能量變化。正因?yàn)镸C運(yùn)動(dòng)的這種局域性，利用并行計(jì)算能量并不能有效地加速M(fèi)C模擬。而且這種并行計(jì)算能量的做法也并不是真正意義上的Parallel MC。真正的Parallel MC是指我們可以平行選取體系中的幾個(gè)局部，而這幾個(gè)局部是彼此對(duì)立的，那么對(duì)每個(gè)部分就可以單獨(dú)施行MC運(yùn)動(dòng)，而不至于相互影響。簡單而言，Parallel MC就是可以同時(shí)改變體系的多個(gè)局部構(gòu)象。很顯然，這與Parallel MD完全不是一個(gè)概念。 [ Last edited by yahoohoo on 2010-9-11 at 19:37 ] |
6樓2010-09-11 19:35:24
2樓2010-09-11 10:57:31
材料類初學(xué)者可以看的書
★ ★
zh1987hs(金幣+2):謝謝您的介紹 2010-09-11 11:31:12
zh1987hs(金幣+2):謝謝您的介紹 2010-09-11 11:31:12
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材料類初學(xué)者可以看的書除了《概率論》《蒙特卡羅方法引論》《蒙特卡羅方法》等MC基礎(chǔ)書外，做材料（主要包括高分子材料，固體材料，薄膜材料）的同行們可以看一下《計(jì)算材料學(xué)》(德)D.羅伯(Dierk Raabe)編著，項(xiàng)金鐘,吳興惠譯；《計(jì)算材料科學(xué)》陳舜麟編著；《分子模擬》(荷)Frenkel，Smit著，汪文川等譯； 這些書既與MC方法有關(guān)，又與你所研究的方向有關(guān)，而且難度并不是特別大。除此之外就是要學(xué)習(xí)編程語言，現(xiàn)在主要用的是fortran,c,VB,這三種都有現(xiàn)成的源程序可以參考，尤其是fortran，專門作科學(xué)計(jì)算用，臺(tái)灣人彭國倫寫的《Fortran 95》就很不錯(cuò)，網(wǎng)上也有電子版，除此之外，還有徐士良的《Fortran算法程序集》。c語言我不太會(huì)用沒有發(fā)言權(quán)。VB的好處就是可視化，操作也很方便，也有大量的應(yīng)用�？傊�，材料是一個(gè)交叉學(xué)科，比較難，所以大家都不能急功近利，要耐得住寂寞，終有所成。上面所列舉的書，本論壇應(yīng)該都有電子版，大家可以查一查。以上是我自己的一家之言，不足之處請(qǐng)大家指正。 |
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neoxie3樓2010-09-11 11:26:06
4樓2010-09-11 13:59:51
5樓2010-09-11 14:19:13
7樓2010-09-11 21:10:15
dellus
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8樓2010-09-12 09:36:34
yalefield
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9樓2010-09-12 09:39:08
10樓2010-09-12 13:36:30
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