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[交流]
【求助】更改源代碼 并行出問題 已有6人參與
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我最近對lammps中 deposit的源代碼進(jìn)行了更改，然后編譯運(yùn)行在我的單核上都沒問題，但在集群服務(wù)器上，就不能輸出dump，運(yùn)行會(huì)自動(dòng)終止，也不報(bào)錯(cuò)，log文件變空白。但在單機(jī)運(yùn)行是沒問題的，自己解決了好久也不知道問題出在哪里，不知道有沒有前輩有類似的經(jīng)驗(yàn)。 我在deposit源文件中增加的代碼如下： int i,j; > int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 感覺就算其中涉及到并行問題的代碼，也就是最后一句，都是模仿lammps源代碼編寫的，不知道問題出在哪里。 希望前輩能給予指點(diǎn)，萬分感謝 謝謝了！！ |
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4樓2010-09-15 15:19:16
2樓2010-09-14 14:57:13
3樓2010-09-14 15:00:31
bluewhale
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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zh1987hs(金幣+3):謝謝指教 2010-09-15 22:55:55
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> int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 首先定位錯(cuò)誤，將最后一行comment掉，編譯后運(yùn)行。如果沒有問題，說明是最后一行的問題，檢查world傳入的是否有問題。 |
5樓2010-09-15 20:43:44
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